Siempre que se hace disponible información por internet es muy conveniente comunicar a los potenciales usuarios las condiciones en las cuales se facilita la información. Las cuestiones de propiedad intelectual no incluyen sólo aspectos económicos o de retorno de beneficios, si no también otros relacionados con la atribución y el crédito por el trabajo realizado o el mal uso de los datos. Uno de los principios fundamentales de GBIF es el reconocimiento explícito a los proveedores originales de la información. En los siguientes apartados de esta misma página pueden obtener más información al respecto.
Todos los acuerdos originales relacionados con el intercambio y el uso de los datos en la red de GBIF están recogidos en el portal del Secretariado de GBIF en la siguiente dirección:
Todos los potenciales usuarios de datos de GBIF, deben leer y comprender el Acuerdo de Uso de los datos de la red de GBIF antes de poder acceder a los datos propiamente dichos. En el siguiente documento puede acceder a la versión en español del acuerdo (acompañada del original en Inglés), proporcionada por la Unidad de Coordinación del Nodo Español de GBIF.
A la hora de compartir datos a través de la red de GBIF, es fundamental que los potenciales proveedores lean y ratifiquen el Acuerdo de Intercambio de datos en la red de GBIF. En el siguiente documento puede acceder a la versión en español del acuerdo (acompañada del original en Inglés), proporcionada por la Unidad de Coordinación del Nodo Español de GBIF.
Principios rectores sobre los Derechos de Propiedad Intelectual
El debate sobre los derechos de propiedad intelectual (IPR - Intellectual Property Rights) ha surgido naturalmente en GBIF, al concebirse desde sus inicios como una infraestructura de libre acceso. En marzo del 2004 se mantuvo una reunión sobre el tema en Madrid con el título "GBIF Experts' meeting on biodiversity data, databases and property rights issues", cuyas conclusiones pueden consultarse en el sistema CIRCA. También puede consultar aquí un documento sobre las principales líneas marcadas en el Memorando de Entendimiento (MoU) de GBIF sobre propiedad intelectual:
Tal y como queda establecido en el "Acuerdo de Uso de los Datos de la Red de GBIF", los usuarios de los datos deben reconocer a los proveedores de datos y a las colecciones el uso de sus datos. En los siguientes documentos, se explica como pueden incluirse las referencias necesarias para cumplir con este requerimiento.
Guía sobre cómo citar datos de especímenes y observaciones, obtenidos desde el portal de datos de GBIF
Estos documentos son borradores en desarrollo, aparecidos en el portal de GBIF Internacional www.gbif.org el 6 de mayo del 2005. Pueden enviarse
comentarios sobre los mismos hasta el 30 de junio del 2005 a la dirección
Acceso libre a los datos sobre biodiversidad
El Órgano de Gobierno de GBIF ha publicado un documento con recomendaciones sobre el acceso libre a los datos sobre biodiversidad, dirigido a consejos de investigación, agencias de financiación y fundaciones privadas. El documento original puede consultarse aquí. A través del siguiente enlace se puede acceder a una traducción proporcionada por la Unidad de Coordinación de GBIF en España.
Para asegurar la interoperabilidad a la hora de consultar diferentes bases de datos de biodiversidad repartidos por todo el mundo es necesario tener un conjunto de información estándar para bases de datos de colecciones de historia natural y observaciones y censos de campo. Se presentan a continuación las dos alternativas más utilizadas en el ámbito internacional.
Darwin Core
Es el estándar para el intercambio de datos de colecciones de historia natural, promocionado por GBIF. El esquema utilizado actualmente corresponde a la versión 2 (DwC2, The Species Analyst). Puede obtener la información más actualizada sobre el estándar en http://digir.net/.
Definición del esquema: campos incluidos
El esquema original de Darwin Core 2 en formato XML (ver. 1.0) puede consultarse en las páginas de digir.net. También están disponibles versiones más legibles en inglés y una versión no oficial en castellano.
Datos y estructuras para migraciones a Darwin Core
Hay disponible una tabla del esquema Darwin Core en MS Access®, probada bajo MS Windows® con ODBC y con ADO:DarwinCore.zip (archivo .ZIP, 158 Kb).
Darwin Core ha sufrido cambios que se reflejan en distintas versiones, de las cuales GBIF soporta las versiones Darwin Core 1.2 y Darwin Core 1.4. Se puede encontrar más información detallada sobre ellas en los siguientes enlaces:
Se trata de un esquema alternativo, desarrollado en el marco del proyecto europeo BioCASe. Es un esquema complejo que alberga casi 1500 conceptos/campos. Los proveedores de datos adaptados al formato ABCD, también pueden ser consultados en el portal de consulta de datos de GBIF Internacional. Puede obtener la información más actualizada sobre el estándar en:
El protocolo de comunicación DiGIR (Distributed Generic Information
Retrieval) es el protocolo utilizado actualmente para el intercambio de información dentro de distintas redes distribuidas como la de GBIF. Es un protocolo en desarrollo y evolución, si bien ya se está utilizando para conectar cientos de proveedores de datos. Para obtener la información más actualizada sobre el proyecto DiGIR, visite las páginas:
Otra alternativa para el intercabio de información entre los proveedores y los servidores de datos, compatible tanto con Darwin Core 2 como con ABCD, es el protocolo TAPIR (TDWG Access Protocol for Information Retrieval). Los grupos de trabajo implicados en el desarrollo de este protocolo trabajan activamente, y ya existen prototipos en pruebas. Puede obtenerse información actualizada en:
Un buen recurso global para obtener información taxonómica sobre plantas,
animales, hongos y microorganismos de todo el mundo es el Catálogo de la vida / Catalogue of Life.
Software avalado por la Unidad de Coordinación de GBIF.ES
Desde la Unidad de Coordinación de GBIF en España se desarrollan programas informáticos, que se ponen a disposición de la comunidad científica española de manera libre y gratuita para facilitar la incorporación de sus datos a la iniciativa de GBIF. Del mismo modo, se da soporte técnico y formación sobre estos programas a todos aquellos investigadores que participan activamente en la iniciativa de GBIF.
Software de informatización de colecciones y proyectos
A la hora de abordar un proceso de informatización, ya sea de una colección de historia natural, de datos de observaciones obtenidas directamente en el campo, de citas provenientes de fuentes bibliográficas, o de cualquier otro origen de datos de biodiversidad, es fundamental conocer las herramientas existentes para realizar la labor con eficiencia.
Acogerse a una iniciativa reconocida de las ya existentes nos garantiza el aprovechamiento de la experiencia acumulada por otros grupos de investigación, permitiéndonos evitar los problemas conocidos y comenzar con efectividad los trabajos de informatización ya desde el inicio de nuestro proyecto. Del mismo modo, nos asegura trabajar de acuerdo con los últimos estándares internacionales referentes a bases de datos biológicas, la interconexión entre distintas bases de datos, y la fácil adhesión a iniciativas internacionales relacionadas como GBIF.
HERBAR: Programa de gestión de colecciones botánicas
HERBAR es el nombre del software para informatizar y gestionar colecciones botánicas recomendado y apoyado por el nodo español de GBIF. Es un programa muy completo, con multitud de funciones y disponible en varios idiomas.
Es la aplicación estándar de la AHIM (Asociación de Herbarios Ibero-macaronésicos) y se utiliza de manera regular en decenas de instituciones españolas para la gestión de herbarios y bancos de germoplasma.
Para obtener más información sobre HERBAR, visite su página web:
ZOORBAR: Programa de gestión de colecciones de historia natural
ZOORBAR es software para informatizar y gestionar colecciones de historia natural recomendado y apoyado por el nodo español de GBIF. Su flexible sistema de atributos permite su adaptación a las características particulares de cualquier colección biológica.
Esta aplicación está teniendo una interesante implantación en la comunidad zoológica española, y varias importantes instituciones ya gestionan sus colecciones de historia natural con ZOORBAR.
Para obtener más información sobre ZOORBAR, visite su página web:
ZOORBAR: Programa de gestión de colecciones de historia natural
Herbar-Zoorbar Ligero es una aplicación para informatizar y gestionar colecciones tanto botánicas como zoológicas. Tiene como objetivo facilitar el intercambio de información entre los usuarios que informatizan el material biológico y la colección principal a través de tablas de Entrada rápida, sin necesidad de que los primeros se instalen la versión completa de Herbar 3.5 o Zoorbar.
Para obtener más información sobre HZL, visite su página web:
BIBMASTER: Programa de gestión de proyectos de biodiversidad
BIBMASTER es una aplicación de bases de datos para gestión de información sobre biodiversidad, haciendo especial hincapié en la información bibliográfica y nomenclatural. Está recomendada y apoyada por el nodo español de GBIF.
Este programa permite la gestión de bibliografías, autores, palabras clave, nomenclatura, check-lists, listas de material, etiquetas de herbario, ilustraciones e información a nivel de taxon.
Importantes iniciativas nacionales utilizan BIBMASTER para gestionar su información, como los proyectos Flora iberica, o Flora Micológica Ibérica.
Para obtener más información sobre BIBMASTER, visite su página web:
FindIt2DarwinCore es un programa que rellena tablas de Darwin Core de MS Access a partir de los nombres científicos almacenados en documentos PDF ubicados en direcciones web. Esta aplicación usa el servicio web FindIT de www.ubio.org y se puede descargar en la siguiente dirección:
DARWIN_TEST: Validación y chequeo de datos en formato Darwincorev2 ó Darwincore1.4
DARWIN_TESTes una aplicación para la validación y comprobación de los registros de DarwinCorev2 ó Darwincore 1.4 (estándar DarwinCore versión 1.2 ó Darwincore versión 1.4, para el intercambio de información de especimenes y observaciones de colecciones de historia natural)
Se recomienda comprobar los datos de DarwinCorev2 ó Darwincore1.4 utilizando el programa DARWIN_TEST para detectar posibles problemas, como paso previo a su publicación para su consulta en internet a través de la red de GBIF. Entre las comprobaciones que se realizan, se analizan errores de omisión, tipográficos, de convención y de coherencia. DARWIN_TEST está basado en Microsoft Access®.
Para obtener más información sobre DARWIN_TEST, visite su página web:
Se trata de una aplicación con base de datos MS Access para desglosar nombres científicos en sus componentes básicos: género, especie, autor de la especie, rango infraespecífico, epíteto infraespecífico, autor infraespecífico y año.
Para descargar y conocer más sobre esta aplicación pinche aquí.
Existen otras iniciativas de desarrollo de software para gestión y explotación de información en biodiversidad. Aquí se presentan algunos ejemplos:
VegAna de la Universidad de Barcelona
La Unidad de Botánica de la Universidad de Barcelona ha desarrollado un paquete integrado de aplicaciones para la gestión y el análisis de datos biológicos llamado VegAna (Vegetation Edition and Analysis). Desde la página principal del proyecto se pueden descargar las siguientes aplicaciones:
Ginkgo: Representación, clasificación y análisis multivariante de datos de biodiversidad.
Quercus: editor de tablas de datos de tipo inventario de especies.
Fagus: Editor y gestor de citas florísticas.
Yucca: representación cartográfica de los datos.
Recientemente se ha añadido una interesante función a este software: ¡Importación y uso de datos de GBIF!
Para obtener más información, visite la página principal de VegAna:
El Secretariado Internacional de GBIF lanza la plataforma de software libre: Integrated Publishing Toolkit (IPT). Uno de los retos de GBIF es eliminar toda barrera a la hora de publicar datos. El nuevo IPT ofrece una interfaz sencilla para publicar datos de biodiversidad en internet.
Puede comprobar un completo listado de software para informatizar colecciones de historia natural en la web del subgrupo "Biological Collection Data" del TDWG. Allí podrá encontrar enlaces a programas como HERBAR, SPECIFY, BIOTICA, RECORDER2000, y muchos más.
Uso de Imágenes Digitales en Colecciones Biológicas
Las nuevas técnicas de informatización de colecciones de Historia Natural y de enriquecimiento de las bases de datos existentes, pasan por la toma de imágenes digitales de los especímenes.
La utilización de imágenes digitales ofrecen muchas VENTAJAS:
Fácil manejo y distribución: los archivos de imágenes pueden transportarse y almacenarse fácilmente, ya sea en CD, DVD o a través de Internet.
Desagregación de los procesos de informatización de colecciones. No es necesario que el proceso de informatización se realice en la misma colección, ni que se produzca traslado de ejemplares: la toma de imágenes puede realizarse en la colección, y el procesado de éstas en otro lugar distinto.
Acceso a gran cantidad de información sin necesidad de acudir a la colección ni manejar el especimen. Hay muchos estudios que podrían realizarse a partir de fotografías digitales, evitando los costes y el posible deterioro de los ejemplares derivados de préstamos y transportes. Este punto es especialmente importante cuando hablamos de material tipo, colecciones históricas o en un estado de conservación delicado.
Libera a los conservadores y al personal asociado a la colección de parte de la tarea derivada de la gestión de préstamos y consultas, que pueden dedicar este tiempo a labores de conservación e investigación.
Ahorra a los investigadores la necesidad de desplazarse hasta la colección para realizar comprobaciones que pueden realizarse a partir de la imagen digital.
Facilita la corrección y actualización de los datos relativos a los especímenes y de las bases de datos asociadas a las colecciones, sin necesidad de acceder de nuevo a los especímenes sino a sus imágenes correspondientes.
Posibilita la repatriación de información de alta calidad a los paises de origen de los datos, que pueden disponer de "colecciones virtuales" de los especímenes recolectados en sus territorios.
y un largo ecétera.
Iniciativas en marcha
Proyectos pioneros
A continuación se presentan algunas de las iniciativas existentes sobre las que, por su envergadura o especiales caracterísiticas, cabe hacer especial mención:
Esta ambiciosa iniciativa del Harvard College pretende crear un catálogo electrónico, accesible vía web, de todos los especímenes tipo para su utilización por parte de taxónomos y especialistas de todo el mundo. Para ello mantienen una completa guía on-line sobre la informatización de tipos y la captura de datos diagnósticos en formato digital.
Parte de los frutos de este esfuerzo ya pueden consultarse en el catálogo on-line de las colecciones de insectos del caribe o los tipos de la colección MZD.
El Jardín Botánico de Nueva York es una de las instituciones pioneras en lo que a creación y acceso a "herbarios virtuales" se refiere. Actualmente contiene unos 800.000 especímenes digitalizados, con unas 120.000 imágenes de alta resolución, disponibles a través de un sistema de búsqueda.
El Museo Zoológico de Amsterdam, en colaboración con el Nodo Nacional de GBIF en Holanda, y con el apoyo técnico de ETI Bioinformatics, ha desarrollado un proyecto de digitalización de especímenes tipo en tres dimensiones (3D), cuyos primeros frutos -una colección de aves- ya pueden consultarse via web. Este singular sistema permite rotar los especímenes y verlos desde cualquier ángulo.
El Centro para la Biodiversidad y la Conservación del Museo Americano de Historia Natural ha desarrollado un sitio web para promover el uso de imágenes y tecnologías de teledetección, centrado sobre temas de conservación de la biodiversidad. Dispone de tutoriales desde los principios básicos hasta el tratamiento avanzado de imágenes.
Aluka es una iniciativa sin ánimo de lucro, cuya misión consiste en crear una biblioteca digital de recursos académicos del mundo en vías de desarrollo y acerca de éste para contribuir a la investigación y a la enseñanza en todo el mundo. Inicialmente se centrará en África. Aluka es uno de los proyectos de la Fundación Mellon, The Andrew W. Mellon Foundation, que se estableció para acelerar los usos productivos de las tecnologías de la información en beneficio de los estudios superiores en todo el mundo.
Otras iniciativas
Aparte de las ya citadas, existen multitud de iniciativas por todo el mundo para tomar imágenes digitales de los especímenes de colecciones de historia natural: algunas de ellas son muy significativas, como el proyecto de digitalización del herbario de tipos de Linneo.
Por supuesto, también existen INICIATIVAS ESPAÑOLAS en esta dirección, entre las que destacan:
Puede comprobar un par de ejemplos de consulta de taxon con imágenes aquí (Anthyllis vulneraria subsp. maritima) o aquí (Passer domesticus): pulse sobre alguno de los enlaces "Imagen".
Metodología
He aquí algunas fuentes a consultar a la hora de proponer o encarar proyectos de toma de imágenes digitales de especímenes:
La RED EUROPEA DE INFORMACION SOBRE BIODIVERSIDAD ENBI incluyó en su paquete de trabajo 6 (Co-operation of pan-European databases on biological collections and specimens) distintas iniciativas relacionadas con el uso de imágenes digitales de especímenes en las colecciones de historia natural. Entre los resultados obtenidos están:
En marzo del 2004 se realizó en Stuttgart (Alemania) un taller sobre técnicas y desafíos del uso de imágenes digitales de tipos biológicos. Los resultados de este taller, incluido un informe detallado sobre el mismo, se pueden consultar en su sección correspondiente de CIRCA.
A finales del 2005 ha sido publicado un manual de buenas prácticas en el uso de imágenes digitales de tipos biológicos. Dentro de las contribuciones realizadas en este manual, destaca la de Arturo H. Ariño y David Galicia sobre el uso de imágenes digitales aplicado a estudios taxonómicos (capítulo 11). El manual completo está disponible para su descarga pulsando aquí.
Dentro del TAXONOMIC DATABASE WORKING GROUP (TDWG) existe un grupo de trabajo enfocado hacia el uso de imágenes en el ámbito biológico. Entre las actividades realizadas, está el mantenimiento de una WiKi como punto de discusión y de publicación de ideas.
Las páginas web de la INICIATIVA E-TYPE también contienen mucha información sobre protocolos, consideraciones y metodología, a la hora de realizar la captura de imágenes con cierto detalle.
La UNIDAD DE COORDINACIÓN DE GBIF EN ESPAÑAorganiza de manera periódica cursos de formación para la informatización de colecciones, en cuyo temario está incluida la informatización de colecciónes a través de imágenes. Visite la sección de eventos del portal de GBIF.ES para estar puntualmente informado de próximas convocatorias.
Datos sensibles en la red de GBIF
Definición
En el contexto de GBIF, denominamos "DATOS SENSIBLES" (en ingles, sensitive data) a aquellos datos de localización de taxones que sería problemático divulgar sin protección. Esta situación puede darse en múltiples contextos:
Información sobre táxones raros, en peligro o protegidos por algún tipo de legislación.
Táxones con valor comercial.
Táxones o hábitats vistosos o frágiles (Ej: orquídeas, lugares de nidificación/cría, etc.).
Datos sobre los que se ha solicitado ocultar la información geográfica (Ej: por petición del dueño del terreno).
Datos de los que se obtiene un beneficio económico.
En otro orden de magnitud, también pueden considerarse datos "temporalmente" sensibles a aquellos que:
Están esperando para ser publicados.
Están siendo utilizados en investigaciones actuales.
El concepto de información sensible, como sucede con otros relacionados como el concepto de endemicidad o rareza, está muy ligado al área geográfica al que nos circunscribamos: lo que en un área determinada pueda considerarse información sensible, en otra área puede estar considerada información de libre distribución. Este hecho adquiere especial relevancia cuando hablamos de duplicados de especímenes almacenados en otras colecciones de historia natural distintas de la original, o simplemente en datos publicados desde fuera del ámbito de influencia de la restricción, legislación, etc.
La inclusión en GBIF de datos sensibles
La publicación de datos sensibles en la red de GBIF pasa necesariamente por un proceso de difuminado o eliminación de la información geográfica que acompaña a los registros.
Lo más importante a tener en cuenta a la hora de publicar datos, sea cual sea el método utilizado para enmascarar esta información, es documentar el proceso realizado y avisar a los posibles usuarios de que los datos disponibles para su consulta no son los originales. Publicando estos datos "difuminados" hacemos ver a los usuarios que la información existe, pero retenemos la capacidad de evaluar de manera individual la conveniencia de distribuir información más detallada.
¿Cómo gestionar estos datos?
El PRIMER PASO a dar es determinar qué registros son los que consideramos sensibles en nuestro ámbito. En el caso de España, es fundamental conocer la legislación internacional, nacional y autonómica aplicable:
Legislación internacional
CITES: Convención sobre el comercio internacional de especies amenazadas de fauna y flora silvestre.
El SEGUNDO PASO es definir qué método de protección vamos a emplear para tratar esos datos:
Eliminar la información geográfica totalmente: tanto la descripción de la localidad como las coordenadas geográficas (si las tiene) del lugar de recolección o avistamiento.
Eliminar la información geográfica parcialmente. Para ello se pueden utilizar distintos métodos:
Redondear las coordenadas hasta un número determinado de decimales (Ej: utilizar cuadrículas que definan al menos un área de 10x10Km).
Eliminar el contenido de los campos más detallados de la descripción de la localidad (Ej: dejar tan sólo la información del país, la provincia o el municipio).
Difuminar los datos geográficos: de manera que aunque se mantenga la precisión de la cita original, no coincida exactamente con el punto de recolección/avistamiento. Se están desarrollando herramientas para automatizar la tarea que cuando estén disponibles, serán publicadas en este espacio.
POR ÚLTIMO, y como hemos dicho al inicio del documento, es fundamental indicar a modo de nota el tipo de proceso que han sufrido los registros con avisos como:
Este especimen pertenece a una especie amenazada o en peligro. La información sobre la localidad específica de recolección ha sido eliminada del registro publicado en internet para proteger a la especie de la recolecta indiscriminada. Los datos eliminados pueden suministrarse a investigadores bajo demanda.
Este especimen pertenece a una especie amenazada o en peligro. La información geográfica que acompaña al registro ha sido degradada hasta una cuadrícula de 10x10Km. Los datos originales pueden suministrarse a investigadores bajo demanda.
I Taller GBIF sobre Gestión de Datos Sensibles
La Unidad de Coordinación de GBIF en España organizó la primera edición del taller sobre Gestión de datos sensibles celebrada los días 15 y 16 de octubre de 2008. En este taller se trató principalmente la cuestión de cómo gestionar la información que se publica en Internet para proteger las especies amenazadas o protegidas por la legislación. También se discutieron otros aspectos que convierten en sensibles los datos.
En la página web del taller http://www.gbif.es/formaciondetalles.php?IDForm=44 están disponibles todos los materiales que se utilizaron durante el desarrollo del mismo: presentaciones, documentación adicional, ejercicios prácticos, resumen del debate mantenido, así como los videos de las sesiones teóricas (http://www.gbif.es/videos/videos.php).
Documentos disponibles
Si desea obtener más información, el Secretariado de GBIF en Copenhague ha publicado varios documentos de interés relacionados con los datos sensibles:
En marzo del 2006, se llevó a cabo una encuesta para evaluar lo que los proveedores de información sobre biodiversidad consideraban información sensible, y los métodos que hasta el momento se habían abordado a la hora de gestionar este tipo de información. Existe un informe sobre los resultados de esta encuesta en:
Tras el análisis de los resultados de esta encuesta y de otras iniciativas afines, se confeccionó un informe sobre la gestión de datos sensibles de localización de especies:
El proceso finalizó con la elaboración de una guía de buenas prácticas. El propósito de este documento es ser un modelo de referencia para instituciones, proveedores de datos y nodos de GBIF a la hora de que éstos elaboren sus propias guías.
GEOLocate tiene como objetivo facilitar la asignación de coordenadas geográficas asociadas a las localidades de las colecciones de historia natural. Se trata de una aplicación capaz de entender las cadenas de texto que contienen las descripciones de las localidades y asignarles o proponer unascoordenadas geográficas. Entre otras particularidades es capaz de asignar coordenadas a intersecciones de carreteras y redes hidrológicas.
Durante los dos últimos años se ha colaborado desde GBIF.ES con los programadores de esta herramienta (The Tulane University Museum of Natural History) para dotar a la aplicación de las listas de topónimos y de las capas geográficas para optimizar las capacidades de la herramienta a las localizaciones españolas. Una vez que es necesario que la aplicación “entienda” la descripción de la localidad se la ha dotado de diccionarios en castellano, vasco, gallego y catalán a parte del inglés que viene por defecto.
Como apoyo a los usuarios de GEOLocate está disponible una lista de distribución (GEOLocate-L) y pronto también una dirección de correo electrónico ayuda_geolocate@gbif.es donde se pueden dirigir consultas, comentarios, sugerencias, etc.
Herramientas para
"mapear"
Herramientas
para ver en un mapa la localización
de datos sobre biodiversidad
Software para descargar:
C-squares mapper
El c-squares mapper del CSIRO Marine Research (CMR) es una utilidad PERL. Las latitudes y longitudes se convierten a c-squares, que son teselas georeferenciadas (cuadrados) que representan porciones identificables de la superficie terrestre. Commonwealth Scientific and Industrial Research Organisation (CSIRO), Australia.
DIVA-GIS DIVA-GIS es un sistema de información geográfica (SIG) gratuito. Se puede utilizar para crear mapas de distribución de especies, mapas de malla de la distribución de la diversidad biológica y predecir la presencia de especies en base al clima, utilizando los modelos BIOCLIM o DOMAIN.
gvSIG gvSIG es una herramienta orientada al manejo de información geográfica. Se caracteriza por una interfaz amigable, siendo capaz de acceder a los formatos más usuales de forma ágil tanto ráster como vectoriales. Integra en una vista datos tanto locales como remotos a través de un origen WMS, WCS o WFS.
Google Earth Google Earth te permite desplazarte a cualquier lugar de la Tierra para ver imágenes de satélite, mapas, relieve y edificios en 3D e incluso explorar galaxias del firmamento. Puedes recorrer contenido geográfico muy variado, guardar los lugares que visites y compartirlos con otros.
Google Maps
Es un servidor de aplicaciones de mapas en Web. Ofrece imágenes de mapas desplazables, así como fotos satelitales del mundo entero e incluso la ruta entre diferentes ubicaciones.
Generic Point Mapper Aplicación Online que permite introducir coordenadas
espaciales en grados decimales. El generic
point mapper utiliza el protocolo XML y permite
que los usuarios personalicen la aplicaciones. Esta aplicación está integrada en el sistema de consultas del portal internacional de GBIF: vea aquí un ejemplo de cómo puede representar espacialmente sus consultas. Canadian Biodiversity Information Facility
(CBIF),
Canadá.
Herramienta para obtener las coordenadas de cualquier dirección o punto en el mapa. Convierte entre coordenadas en grados decimales y grados, minutos y segundos. Pon etiquetas de localización a tu blog, página web o RSS.
La página web de GEOteca (guía de recursos geográficos) ha sido desarrollada por profesores y alumnos de la Universidad Autónoma de Madrid en el contexto de los Programas de Innovación Docente.
Recoge referencias a información geográfica que se puede encontrar en Internet:
Publicaciones digitales geográficas y medioambientales, licenciaturas, departamentos, sociedades, bibliografía...
Sistemas de Información Geográfica (SIG) españoles en Internet.
Recursos internacionales.
Imágenes de satélite de España y software para su tratamiento.
Servidores de datos estadísticos, locales, provinciales, regionales, nacionales e internacionales, sobre población, recursos productivos recursos naturales, documentación, bibliografía etc.
Códigos para países y subdivisiones de países (ISO 3166)
A la hora de realizar migraciones de datos es muy importante adscribirse a denominaciones y codificaciones aceptadas internacionalmente para posibilitar posteriores intercambios de datos y la compatibilidad con iniciativas globales.
Tabla MS Access® de países con los códigos ISO 3166-1
de dos y tres letras, y los nombres en español: Paises.zip (archivo .ZIP, 21 Kb - Actualizado 12-02-2007).
Tabla con los códigos para subdivisiones de
países (estados, departamentos, provincias, etc.)
tal y como son definidos en el estándar ISO 3166-2
(60 países): Provincias.zip (archivo .ZIP, 45 Kb).
Servicios de
toponímia en Internet
Servicios para georreferenciar
registros, que permiten buscar
y visualizar topónimos en un mapa.
Toponimia Española
Toponímia de Cataluña (ICC):
El Instituto Cartográfico de Cataluña (ICC) pone a disposición de los usuarios de manera gratuita, mapas a distintas escalas (desde 1:5.000 a 1:50.000), y un servicio de búsqueda de nombres para localidades catalanas.
http://www.icc.es/
Toponímia de Galicia del SITGAWEB (Xunta de Galicia, SITGA):
Actualmente en desarrollo y accesible únicamente vía Intranet para el personal de la Sociedad para el Desarrollo Comarcal de Galicia. Toponímia a escala 1:25.000. Coordenadas en UTM huso 29. Servicio de Información
Territorial de Galicia
La Infraestructura de Datos Espaciales de España (IDEE)tiene como objetivo el integrar a través de Internet los datos, metadatos, servicios e información de tipo geográfico que se producen en España, a nivel nacional, regional y local, facilitando a todos los usuarios potenciales la localización, identificación, selección y acceso a tales recursos, a través del geoportal www.idee.es.
BioGeoMancer
Puede cortar y traducir topónimos en lengua inglesa en el corespondiente par de coordenadas (latitud/longuitud). Proporciona estimaciones de desvío según la distancia y dirección al topónimo más próximo. Aplicación online. Informatics Biodiversity Research Center, University of California at Berkeley, EE.UU.
Getty Thesaurus of Georaphic Names Online
Se trata de un diccionario estructurado, a nivel mundial, que contiene 1,3 millones de nombres, incluyendo nombres vernáculos e históricos, coordenadas y tipos de lugar, con notas descriptivas, centrado principalmente en lugares inportantes para el estudio del arte y la arquitectura.
Geographic Names Information System (GNIS) USGS en cooperación con el U.S. Board on Geographic Names (BGN): contiene casi 2 millones de topónimos en los EEUU y la Antártida. Cada referencia incluye estado, condado y coordenadas geográficas.
INSPIRE es una iniciativa lanzada por la Comisión Europea cuyo objetivo es hacer disponible información geográfica relevante, homogénea y de calidad.
INSPIRE quiere poner en movimiento la creación de una Infraestructura de Datos EspacialesEuropea que ponga a disposición de los usuarios servicios integrales de información espacial, enlazados por protocolos y estándares comunes. Los servicios deben permitir identificar y acceder información geográfica desde un amplio rango de recursos, tanto a nivel local como global, y de forma interoperable y versátil. Algunos servicios posibles serían la visualización de capas temáticas, superposición de información procedente de fuentes diferentes, análisis temporales y espaciales etc.
En Europa, INSPIRE GEO-PORTAL es el punto de acceso por Internet a los datos espaciales y servicios relacionados (prototipo experimental). Su dirección es http://eu-geoportal.jrc.it/.
Global Spatial Data Infrastructure (GSDI) La asociación GSDI es una organización de organizaciones, agencias, compañías y particulares de todo el mundo. El objetivo de esta organización es promocionar la cooperación y la colaboración internacional para apoyar el desarrollo local, nacional e internacional de infraestructuras de datos espaciales, que permitirá a las naciones abordar cuestiones sociales, económicas o medioambientales de suma importancia.
Ver espacialmente los datos puede ayudar a detectar y eliminar errores, aumentando la calidad de los mismos. Algunas de estas herramientas -comúnmente denominados sistemas de información geográfica (SIG o GIS en inglés)- tienen además funciones analíticas que permiten predecir distribuciones.
Entre las iniciativas internacionales que están en desarrollo actualmente, GEOSS, el Sistema Global de Sistemas de Observación Terrestre (Global Earth Observation System of Systems) es uno de los más importantes. Se trata de un esfuerzo de colaboración internacional, coordinado por la Agencia de Protección Medioambiental estadounidense, que pretende reunir las distintas iniciativas de software y hardware actuales y futuras, y ponerlas a disposición pública sin coste alguno.
GEOSS, que puede verse como homólogo a GBIF en el campo de la información geográfica, está destinado a convertirse en un elemento clave que permitirá realizar grandes avances en el análisis y el uso de la información sobre biodiversidad, al hacer disponer grandes conjuntos de datos y las herramientas necesarias para realizar estudios a gran escala.
Transformación desde distintos
sistemas de referencia, proyecciones cartográficas
y datums a coordenadas geográficas
Una de las operaciones más comunes a realizar con datos georreferenciados es la transformación entre distintos tipos de coordenadas. Puede acceder a un pequeño tutorial sobre transformación de coordenadas aquí.
Georeferencing
Calculator Es un applet de java creado como herramienta para georeferenciar
topónimos. La aplicación estima el error
utilizando los métodos descritos en los Georeferencing
Guidelines.
Mammal Networked Information
System (MaNIS)
University of California, Berkeley, EE.UU.
El objetivo principal de la aplicación Lifemapper es proporcionar mapas de distribución y modelos predictivos. Los mapas son generados utilizando algoritmos genéticos para la producción de conjuntos de reglas (Genetic Algorithm for Rule-set Production, GARP) mediante correlación entre la ocurencia de una especie (->Proyecto The Species Analyst) y la información ambiental (temperatura, precipitación, uso de suelo, altitud, etc.).
Ya pueden consultarse los mapas con los datos reales recogidos y los generados con los modelos predictivos. Biodiversity Research Center, Univ. Kansas, EE.UU.
La aplicaciónWhyWhere combina una imensa base de datos ambientales, imágenes de satélite, potentes algoritmos de procesado de imágenes y cluster computing en un sistema único de búsqueda y online-mapping que da respuesta a la pregunta “¿dónde está y porqué?” de cualquier especie, en cualquier lugar del mundo. Univ. California, San Diego, EE.UU.
Este artículo proporciona información clara y actualizada sobre las técnicas de modelado de nicho ecológico y de generación de modelos de distribución potencial. Se hace énfasis en su aplicación en el campo de la conservación de la flora y en escenarios de cambio climático. Y se hace referencia a redes de biodiversidad como GBIF.
Esta guía es uno de los resultados del proyecto BioGeomancer y en ella se discuten en profundidad las mejores prácticas para la georreferenciación de datos de especies. Esta publicación contiene ejemplos de cómo georreferenciar un amplio rango de tipos de localidades y provee información y ejemplos de cómo calcular la extensión y máxima distancia para localidades basados en la información proporcionada.
La calidad de los datos y los errores que puedan cometerse en los datos son a menudo temas descuidados en bases de datos ambientales, sistemas de modelado, SIG, etc. Demasiadas veces los datos son usados sin pensamiento crítico ni considerando los errores que puedan contener, llegando así a resultados incorrectos, información errónea, toma de decisiones poco prudentes e incremento de costes. Esta publicación se centra en estos temas y discute un buen número de principios sobre calidad de datos a seguir por las colecciones de historia natural antes de publicar sus datos a redes mayores.
Principios y Métodos para resolver errores en los datos
Este documento examina los métodos para prevenir así como detectar y limpiar errores en las bases de datos de colecciones de historia natural. Aquí se presentan las guías, métodos y herramientas que pueden ayudar a las colecciones a la hora de digitalizar, documentar y validar información. Pero primero, establece una serie de principios básicos que deben ser seguidos en cualquier procedimiento de limpieza de datos.
Este artículo revisa los usos de los datos sobre presencia de especies en investigación, educación y otras áreas de desarrollo humano y proporciona ejemplos de estos usos. La publicación no sólo revisa datos observacionales sino también datos procedentes de colecciones de museos y herbarios, los cuales representan almacenes de información a largo plazo y cuyos datos están casi sin explotar.
Esta guía con las mejores prácticas para generalizar datos sensibles proporciona la clave a los proveedores de datos a la hora de determinar si una especie debe considerarse sensible así como su grado de sensibilidad. Además, proporciona guías para la correcta redacción que se debe utilizar en documentación, métodos para generalizar los datos tanto espaciales como no espaciales.
Las obserbvaciones que se hacen de la naturaleza son la base de los estudios ecológicos, los cuales utilizan estas observaciones para establecer patrones en la naturaleza y en la conservación de la biodiversidad. Los datos observacionales son el princpal componente de los "datos de biodiversidad primaria".
La elaboración de bases de datos es una labor costosa
cuyos resultados no se obtienen sino a largo plazo. Es por ello que su
rentabilidad debe plantearse desde la perspectiva de la utilidad. Al iniciar la
informatización de una colección, es necesario plantear de manera
cuidadosa unos objetivos a conseguir y cómo la base de datos que
pretendemos elaborar los va a cumplir. No hacerlo así es tirar tiempo y dinero.
De la experiencia adquirida en la información de colecciones de
nuestro centro, sabemos que la parte más costosa del proceso de informatización
es la relacionada con el trasiego del material entre el depósito y el
ordenador, tanto para la introducción de los datos como para su corrección.
Por esta razón es mejor proceder a informatizar las colecciones de manera
completa por grupos taxonómicos, a informatizarlas parcialmente en su conjunto.
La informatización de un herbario, a nuestro entender, debe cubrir tres
objetivos:
Contribuir a explotar de una manera más completa la información que
contiene. Esto es especialmente deseable en los campos de la Ecología,
Fenología, Historia, Nomenclatura y estudios de impacto ambiental.
Proteger el material conservado. Para una parte considerable de las
consultas no se hace necesario la manipulación del material o bien esta
se reduce considerablemente.
Contribuir a la gestión del herbario en tareas tales como el etiquetado
y confección de listas de envío e intercambio.
El sistema que hemos desarrollado y usamos (HERBAR)
cumple de una manera razonable los objetivos mencionados. Uno de los peligros
que se corre en la confección de una base de datos de herbario es que el
esfuerzo que supone su realización sea desproporcionado en relación al uso que
se va a hacer de la misma. Por este motivo, resulta especialmente interesante
ligar la informatización de colecciones a proyectos de investigación en curso
que, de alguna manera, precisen de la información contenida en las mismas. De
este modo la utilidad del trabajo es patente y se consolida la viabilidad del
mismo.
Por último, indicar que para el éxito de una base de datos de herbario es
necesario integrar el crecimiento y mantenimiento de la misma en la rutina de trabajo del herbario. Un paso importante en este sentido es conseguir que los
recolectores que aportan más material al herbario utilicen una base de datos
semejante a la del herbario para etiquetar y llevar el registro de su material.
Tratar de abordar la informatización del herbario como una acción
extraordinaria, limitada en el tiempo, implica que, cuando las colecciones
crezcan, las bases de datos dejan de ser representativas de las mismas. Al
diferir la información contenida en el herbario y en la base de datos, esta
última pierde interés y se abandona.
La Unidad de Botánica de la Universidad de Barcelona ha desarrollado un paquete integrado de aplicaciones para la gestión y el análisis de datos biológicos llamado VegAna (Vegetation Edition and Analysis). Desde la página principal del proyecto se pueden descargar las siguientes aplicaciones:
Fácil manejo y distribución: los archivos de imágenes pueden transportarse y almacenarse fácilmente, ya sea en CD, DVD o a través de Internet. 
La RED EUROPEA DE INFORMACION SOBRE BIODIVERSIDAD 
En el contexto de GBIF, denominamos "DATOS SENSIBLES" (en ingles, sensitive data) a aquellos datos de localización de taxones que sería problemático divulgar sin protección. Esta situación puede darse en múltiples contextos: 
Legislación internacional 
