DARWIN TESTes una aplicación diseñada para la validación y chequeo de los datos presentados en tablas DARWINCOREV2 y DARWINCORE14 (formato estándar Darwin Core versión 1.2 y 1.4 http://wiki.tdwg.org/twiki/bin/view/DarwinCore/) utilizado por el GBIF para el intercambio de información de observaciones y especímenes conservados en colecciones de historia natural.

Se recomienda el uso de esta herramienta para la validación de los datos del formato DARWIN CORE, antes de subir los datos al servidor para su visualización en la red de GBIF (http://www.gbif.es/). DARWIN TEST está desarrollado y apoyado por la Unidad de Coordinación del Nodo Nacional de GBIF en España.

Manejo de datos

• Permite validar y chequear los campos de las tablas DARWINCOREV2 o DARWINCOREV14 (formato estándar Darwin Core versión 1.2 y Darwin Core 1.4) con consultas predeterminadas configurables.
• Permite la activación/desactivación de las consultas existentes.
• Permite la creación de nuevas consultas de validación adaptadas a las necesidades de cada usuario.
• Ofrece la posibilidad de corregir los errores detectados en los datos desde los propios formularios de validación. Dichos cambios pueden integrarse de forma permanente en la tabla Darwincorev2 o 1.4 de origen o reflejarse en una tabla intermedia (Darwincorev2Validada/ Darwincore14Validada). El siguiente video muestra un ejemplo esta nueva funcionalidad.
• Permite el chequeo de los nombres científicos con la Tabla de Nombres SCIENTIFIC_NAMES del consorcio The Catalogue Of Life: JTIS y Species 2000, con la tabla Archivos de Autoridad Taxonómica (AAT) del SIB de Colombia, o con otra base de datos con nombres científicos que cumpla unos requisitos mínimos.
• Permite convertir coordenadas UTM, MGRS o coordenadas sexagesimales en coordenadas geográficas en grados decimales, utilizadas en las tablas DARWINCOREV2 y DARWINCOREV14.
• Chequea la existencia de caracteres ASCII anómalos y los reemplaza por caracteres válidos que puede definir el usuario.
• Permite crear un índice de calidad aparente (ICA) para el seguimiento de la mejora de la calidad de los datos.
• Permite la creación y gestión de filtros de usuario para eliminar registros o generalizar coordenadas selectivamente de las tablas DARWINCOREV2 y DARWINCOREV14.
• Permite el intercambio de datos entre los formatos Darwin Core 1.2, Darwin Core 1.4 y Darwin Core Archive (exportación entre versiones).
• Posibilita la importación de datos procedentes de archivos eml y xml.

Detalles técnicos

• DARWIN TEST está basado en Microsoft Access© XP.
• Consta de una base de datos Darwin_test.mdb a la que se vincula la tabla DARWINCOREV2 o DARWINCORE14 y otras tablas de referencia para chequeos contra bases de datos externas.
• Interfaz gráfico de fácil manejo a través de formularios.
• Código fuente accesible desde la página del proyecto en Sourceforge.net bajo licencia Creative Commons.

Con la colaboración de CATALOGUE OF LIFE

NUEVA VERSIÓN DARWIN TEST 3.2 RECOMENDADA

En esta nueva versión de Darwin Test se mejora la opción para trabajar con ficheros Darwin Core Archive, el nuevo estándar de publicación de los datos en la red de GBIF. Además, se incorpora la posibilidad de importar metadatos procedentes de archivos eml.xml (en su variante GML Gbif metadata profile); se mejora el cálculo del ICA (Índice de Calidad Aparente); y se ha mejorado la interfaz gráfica que la hace más manejable. También es posible ahora la conversión entre tablas Darwin Core 1.2, Darwin Core 1.4 y ficheros "Darwin Core Archive" de todas las maneras posibles.

VIDEOS TUTORIALES de la versión Darwin Test 3.1

1. Comprobar y corregir datos en Darwin Test
2. Detectar caracteres ASCII
3. Configurar la validación de datos
4. Índice de calidad aparente
5. Generalizar y eliminar coordenadas
6. Transformar a coordenadas decimales

Catalogue of Life es un producto conjunto de Species 2000 e ITIS. Catalogue of Life ha sido planificado para ser un extenso catálogo de todas las especies de organismos vivos sobre la Tierra para el año 2011. Los rápidos progresos que se han llevado a cabo recientemente han hecho que la décima edición de la Annual Checklist contenga 1.257.735 especies. Es probablemente más de la mitad de las especies conocidas de todo el mundo. Esto significa que, para muchos grupos, esto continua siendo insuficiente.

ITIS (Integrated Taxonomic Information system) es una asociación de agencias federadas y otras organizaciones de Estados Unidos de América, Canadá y México, con administradores de datos y expertos de todo el mundo. Species 2000 es una "federacion" de organizaciones de bases de datos trabajando de forma muy cercana a los usuarios, taxónomos y agencias de patrocinadores.

Species 2000 en asociación con ITIS actualmente producen Catalogue of Life. Éste es utilizado por GBIF como la columna vertebral taxonómica de su portal web. Species 2000 recibe financiación de GBIF.

Consulte aquí las Bases de datos que han suministrado datos para la 2010 Annual Checklist, participantes en el proyecto.

The Catalogue of Life agracede a todos los que han contribuido tanto al contenido como a la producción de la Checklist anual, especialmente a Species 2000 Asia-Oceania, Species 2000 europa, NBII, GBIF, University of Reading (Centre for Plant Diversity and Systematics), European Commission (EC EDIT NoE), WorldFish Center (SeaLifeBase project), NIES and ETI BioInformatics, Encyclopedia of Life and Consortium for the Barcode of Life. Gracias también a Paul Klinkenberg, ETI BioInformatics por el diseño de la cubierta, a Peter Brewer, Reading y a Eli Agbayani, WorldFish Center por el apoyo en la base de datos online.

Agradece también a todas las personas de la comunidad GSD que han proporcionado un valioso soporte en la exportación de datos y su transformación: Anton Güntsch, Angel Anta, Johannes Goll, Richard Flood, Bart Vanhoorne, Silvia Lusa, Antonella Linguanti, Rosario Dioguardi y Sergey Jezniakowsky.

Cómo citar las bases de datos individuales incluidas en este trabajo, por ejemplo:
Yu D.S.K. (2010). Taxapad Ichneumonoidea (May 2009 version). In Species 2000 & ITIS Catalogue of Life: 2010 Annual Checklist (Bisby F.A., Roskov Y.R., Orrell T.M., Nicolson D., Paglinawan L.E., Bailly N., Kirk P.M., Bourgoin T., Baillargeon G., eds). DVD; Species 2000: Reading, UK.

Cómo citar la clasificación taxonómica de Catalogue of Life:
Bisby FA, Roskov YR, Orrell TM, Nicolson D, Paglinawan LE, Bailly N, Kirk PM, Bourgoin T, Baillargeon G., eds (2010). Species 2000 & ITIS Catalogue of Life: 2010 Annual Checklist Taxonomic Classification. DVD; Species 2000: Reading, UK.

Los Archivos de Autoridad Taxonómica son listas de referencia de todos los nombres científicos disponibles (nombres correctos y sus sinonimias) de las especies que están disponibles. Dichos nombres están organizados en forma jerárquica según uno o varios sistemas de clasificación y se encuentran documentados con sus fuentes bibliográficas en todos los casos, y con sus respectivas autoridades en las categorías que sean requeridas.

Para obtener toda la información y la manera de cuando usarlos, cómo se pueden consultar, cómo se pueden utilizar y qué Archivos de Autoridad Taxonómica estan disponibles en formato .xml, entre en la página del Sistema de Información sobre Biodiversidad de Colombia.

Pulse Aquí para descargar la Tabla AAT de Archivos de Autoridad Taxonómica del SIB de Colombia (Base de datos MS Access, ZIP 935 Kb).

Para visualizar cómo se configura y se validan los datos del estandar Darwincore contra la tabla AAT de archivos de autoridad taxonómica, pulse aquí para ver un ejemplo a través de su navegador de Internet.

Con la colaboración del SIB de Colombia

Acceda directamente a la página del SIB de Colombia pulsando aquí para obtener toda la información sobre el acceso y uso de los AAT.

Autor (Apellido en mayúscula inicial e inicial nombre, idem) . Año >
Nombre de la base de datos. Institución. Ciudad, > País. Disponibilidad del recurso. Versión. > URL

Ejemplo:
Vítolo A. 2004. Archivo de autoridad taxonómica de escarabajos tigre > (Coleoptera:
Cicindelidae) de Colombia. Instituto de Investigación de > Recursos Alexander
von Humboldt. Bogotá, Colombia. x p.Base de datos en > línea. Versión 1.0.
URL: > http://www.humboldt.org.co/sib/content.jsp?doc=aat >