Estado: cerrado

Este taller tratará el proceso de captura, manejo y publicación en internet de imágenes digitales de especímenes de colección y de otras imágenes relacionadas con proyectos de investigación en biodiversidad: láminas, preparaciones microscópicas, etc.

Los temas a tratar irán desde el equipamiento necesario y su configuración (óptica, iluminación, etc.), las técnicas de captura, el procesado de las imágenes y los (meta)datos a recoger para su publicación.

Los alumnos podrán aportar sus propias imágenes, que se procesarán y se publicarán en un servidor instalado al efecto.

Debido al número limitado de plazas disponibles, las solicitudes presentadas se someterán a un proceso de selección donde se evaluarán los siguientes aspectos:

• Adscripción a una institución que colabore y/o provea datos a través de la red de GBIF.
• Número de solicitudes presentadas desde esa misma institución.
• Conocimientos sobre la materia.
• Solicitud y/o presencia en talleres anteriores de GBIF España.
• Orden de inscripción.

Con la colaboración de:

1. Construcción de un sistema de gestión y publicación de imágenes digitales.
   • Obtención de la imagen digital.
   • Tratamiento posterior de las imágenes.
   • Diseño e implementación de bancos de datos asociados.
   • Diseño e implementación de interfaces.
      
2. Interrelación con otros sistemas de información biológica.
    
3. Algunas iniciativas existentes.
   • Flora brasiliensis (Centro de Referência em Informação Ambiental, Brasil).
   • Otros ejemplos destacados.
      
4. Tecnologías de almacenamiento y gestión de imágenes.
   • Servidores de imágenes.
   • Repositorios de archivos.
      
5. Parte práctica: publicación en Internet de imágenes aportadas por los alumnos.
    
    

1. Fundamentos de la imagen digital.
   • Óptica y Física de la formación de la imagen.
   • Tecnología de los sensores de imagen.
   • Sistemas y formatos de almacenamiento y transferencia.
      
2. Técnicas de captura.
   • Preparación física de los objetos.
   • Integración de sistemas ópticos y fotográficos.
   • Técnicas de iluminación.
   • Adquisición de la imagen: casuística.
     • Imágenes planares: herbarios.
     • Imágenes tridimensionales: especímenes de gran tamaño.
     • Macrofotografía.
     • Microfotografía.
   • Imagen morfométrica.
      
3. Post-procesado de la imagen.
   • Retoque y modificación.
   • Automontaje.
   • Morfometría.
      
4. Problemas en imagen digital.
   • Precisión espacial, escalas y paralaje.
   • Distorsión y aberración.
   • Fidelidad cromática.
   • Metadatos y gestión de archivos.

NOTA: El taller se impartirá en sesiones de mañana y tarde, de 9:00 a 18:30h.

PRESENTACIONES MOSTRADAS DURANTE EL TALLER

1. El proceso de publicación de imágenes digitales en Internet, Sidnei de Souza (fichero .PPT, 17.3 Mb).
2. Práctica con un servidor de imágenes y metadatos, Sidnei de Souza (.PDF, 561 Kb).
3. Práctica con un visor de imágenes en web, Silvia Lusa Bernal (.PDF, 224 Kb).
   

PROGRAMAS INFORMÁTICOS UTILIZADOS DURANTE EL TALLER:

1. Zoomify: programa que permite publicar imágenes digitales en internet basado en tecnología flash, con un sistema de navegación rápido y sencillo. Hay disponible una versión gratuita.
   http://www.zoomify.com/
    
2. GIMP: programa de edición y tratamiento de imágenes digitales libre y gratuito. Está disponible bajo la licencia GNU General Public License.
   http://www.gimp.org.es/
    
3. CombineZM: programa de tratamiento de imágenes de código abierto, que permite la combinación de varias imágenes para la creación de imágenes de profundidad de campo ampliada.
   http://hadleyweb.pwp.blueyonder.co.uk/CZM/News.htm
    
4. ImageJ: programa de tratamiento y análisis de imágenes digitales de código abierto, escrito en Java.
   http://rsb.info.nih.gov/ij/
    
5. Infranview: Visor de imágenes compacto para sistemas MS Windows. Gratuito para uso no comercial.
   http://www.irfanview.com/
    
6. ThumbPlus: Utilidad de catalogación de imágenes digitales con miniaturas y automatización de tareas. Hay disponible una versión de evaluación.
   http://www.cerious.com/
   

FOTOGRAFÍAS DE LAS SESIONES:

• Foto 1 (calidad baja - calidad alta): Sidnei de Souza.
• Foto 2 (calidad baja - calidad alta): alumnos.
• Foto 3 (calidad baja - calidad alta): práctica de publicación de imágenes en internet.
• Foto 4 (calidad baja - calidad alta): Arturo H. Ariño.
• Foto 5 (calidad baja - calidad alta): David Galicia y Arturo H. Ariño.

• Häuser,C.L., Steiner,A., Holstein,J. & Scoble,M.J. (eds.), 2005, Digital imaging of biological type specimens. A manual of best practice. Results from a study of the European Network for Biodiversity Information. Stuttgart. viii + 309 pp.

• Sección sobre imágenes digitales del portal de GBIF España.
• Web de la Flora brasiliensis.
• Web del Museo de Zoología de la Universidad de Navarra.
• Zoomifyer: software de navegación en imágenes digitales.