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| Home > Recursos > Herbar > Herbar 3.3 |
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| Novedades de la versión 3.3 |
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Resumen:
Se desarrolla soporte para "colocar" datos
en Internet, etiquetar material sin numerar y convertir
coordenadas UTM, además de otros cambios y mejoras menores.
| Etiquetas para
material sin numerar (por "Entrada Rápida") |
Ahora es posible etiquetar material no numerado. Tan solo
es necesario que esté en herbario.mdb como una tabla de
entrada rápida. Se puede acceder a esta función desde
la pantalla de etiquetas o desde la de entrada rápida:
| Opciones para exportar datos para ponerlos accesibles por Internet |
El valor añadido que una base de datos consultable
por Internet da al herbario es enorme. Dotar de bases
de datos en línea a las colecciones es la tendencia
y es el futuro inmediato.
La aparición de herramientas y servicios como BWS y GARP
(http://biodi.sdsc.edu/bsw_home.html)
o LIfeMapper (http://beta.lifemapper.org)
son solo la punta de lanza de lo que se avecina: distribuciones
potenciales, modelado de escenarios de cambio climático,
evaluaciones de impacto de transgénicos o de especies
invasoras, etc. Y todo basado en bases de datos en línea
de colecciones de historia natural.
En esta versión de Herbar se introduce la opción de exportar
los datos de la colección (DETER+ESPEC) a tablas "planas".
Listas para ser "enganchadas" vía ODBC a sistemas como:
REMIB y TSA, son hoy por hoy las dos únicas redes de de
información en biodiversdad --basadas en colecciones--
que funcionan en el mundo y las Colecciones de Criptogámia
de Real Jardín Botánico están integradas en ambas. En
esto somos pioneros en Europa.
Para Incorporar una base de datos a REMIB y TSA hemos
contado con la ayuda indispensable de la gente de CONABIO
(Méjico)y de David Vieglas y su equipo (University of
Kansas), pero el primer paso es tener las tablas que genera
Herbar a este fin (o equivalente). Las nueva pantallas:
 |
 |
| Pantalla de configuración |
pantalla de exportación |
Esta nueva funcionalidad requiere de una información adicional
que afecta a la configuración del programa y repercute
en su estructura.
De la configuración, hay ahora un apartado al efecto dentro
de "configurar acceso a datos de las colecciones"
Y los cambios de estructura necesarios se enumeran en
el siguiente link: Cambios requeridos
en la estructura de las bases de datos de Herbar
| Campo de precisión para la georreferenciación |
Dado el uso cada vez mas extendido que se hacen de los
datos de las colecciones para análisis espaciales, se
hace también más necesario conocer la precisión con que
se dan las coordenadas de los puntos de recolección. Para
dar cuenta de este aspecto, introducimos un nuevo campo,
"RadioPunto". Este campo se introduce en la tabla ESPEC
y en la tablas tipo "Entrada rápida" y en el el se introduce
el radio de error, en metros, cuando se conoce. El estándar
de referencia de este nuevo campo los constituye el llamado
"Darwin Core" (http://elib.cs.berkeley.edu/manis/darwin2jrwConceptInfo.htm),
que está en vías de convertirse en el estándar de
facto para interoperabilidad de colecciones biológicas
(léase para posibilitar búsquedas múltiples de datos de
colecciones por Internet).
Si el campo UTM contiene una coordenada UTM, no es necesario
rellenar RadioPunto, ya que el grado de error viene implícito
en la coordenada UTM:
| Ejemplo de coordenada |
Radio de error en
metros(aprox.*) |
| 30TUK |
100000 |
| 30TUK24 |
10000 |
| 30TUK2345 |
1000 |
| 30TUK230456 |
100 |
| 30TUK23014567 |
10 |
| 30TUK2301245678 |
1 |
*en rigor sería el radio
indicado multiplicado por 0.707106781
Cambios requeridos en la estructura
de las bases de datos de Herbar
| Campos y tablas para adscribir las identificaciones a tratamientos taxonómicos publicados |
|
De la misma manera cuando, se consultan en línea la información
de las colecciones, al no especialista le resulta muy
dificil valora fiabilidad de una identificación o conocer
el sistema de referencia (i.e. el tratamiento taxonómico)
empleado para la identificación. Por ejemplo, el concepto
(la planta) que hay detrás del nombre "Cheilantus pteridioides"
no es lo mismo si seguimos Flora iberica. o la
Med Checklist y por tanto saber que tratamiento se sigue
supone una gran ayoda para valorar la información. Este
cambio repercute en Herbar en las siguientes pantallas:
Las pantallas de introducción de datos de pliegos
tiene un nuevo campo (TAXONOMIA), donde se almacena
el tratamiento taxonómico seguido en la identificación.
También hay un nuevo botón para introducir tratamientos
taxonómicos: |
 |
 |
La referencia a tratamientos taxonómicos toma
la forma de referencia bibliográficas |
Una mayor información en este aspecto redundará en una
mayor precisión de los datos y por tanto en la fiabilidad
de los análisis para los que se utilicen.
Cambios requeridos en la estructura de las bases de datos
de Herbar
| Conversión de UTM a coordenadas lat/long |
Las tablas que se generan para "Exportar para Internet"
en cualquiera de sus modalidades (HERBAR, REMIB, TSA)
realizan la conversión de UTM a coordenadas lat/long para
los registros que contengan los datos. El formato de salida
es siempre grados y decimales de grado (signo menos para
latitud sur y longitud oeste). Los formatos de entrada
admitidos son:
|
Tipo |
Ejemplo: |
Nota |
| Gradosºminutos'segundos"[NS]
Gradosºminutos'segundos"[EW] |
30º50'15"N 2º30'10"W |
No hay conversión, solo
cambio de formato |
| UseZoneX100LetterY100LetterEastingNorthing |
30TUV4050 |
|
| UseZone Easting Northing |
30T 440 4650 |
|
| [-]Grados.decimales de
grado grados [-]grados.decimales de grado |
20.20 -2.80 |
No hay conversión; solo
la separa en dos campos |
Respecto de los programas que realizan la conversión de
coordenadas, estos mi traducción en Visual Basic de las
versiones en PowerBASIC que realizaron Yvan Barbier y
Pierre Rasmont (Laboratoire Zoologie, Universite de Mons-Hainaut,
Avenue Maistriau, 19, B-7000 Mons, Bélgica) de las rutinas
en FORTRAM de programa MANDRAS de la antigua DMA, ahora
NIMA (National Imagery and Mapping Agency--E.E.U.U.,
http://www.nima.mil/GandG/metadata/dt-md.html)
Nota: Para puntos del "Viejo mundo", la conversión utiliza
el datum geodético WGS-84, lo que da un error de unos
200 m con respecto a las coordenadas calculadas sobre
los mapas de IGN o del SGE, que utilizan el datum "European
50". Para puntos de las Américas se utiliza el datum de
"Clarke 1866", que es el que utilizan la mayoría de los
mapas de esos pagos.
| Menú inicial y configuración |
Se accede ahora a las principales opciones de Herbar sin
salir del menú principal.
La función de inicializar base de datos de gestión ha
sido reprogramada y en nuestras pruebas --al contrario
de lo que sucedía en versiones anteriores-- funciona siempre
a la primera.
Tampoco es necesario ahora especificar el directorio o
carpeta donde reside MS-Word
Documentos de utilidad que van en el zip de Herbar:
- Modelo de condiciones y peticiones para muestreos
destructivos
- Algunos ejemplos, ver ficheros: Destructive Sampling
BERK.htm, Destructive Sampling NYBG.htm, Destructive
Sampling FH.rtf, Destructive Sampling SI.doc,
- y los modelos que tenemos en MA: Destructive Sampling
MA.doc, muestreo_destructivo.doc, muestreo_destructivo.pdf.
- Procedimiento y modelo para documentar que un material
de herbario es testigo ("voucher") de un análisis
molecular
Ver fichero: Testigo_ADN.pdf
| Resumen de cambios en las estructuras de las bases de datos de Herbar |
Todos los cambios aquí especificados son opcionales, esto
es Herbar 3.3 funciona normalmente con las estructuras
de Herbarsys y mdb "tipo COL" de versiones anteriores
con la única limitación de que las opciones nuevas no
estarán operativas (y que puntualmente el programa pregunte
por un campo, a lo que debemos responder con un "return").
| Área |
Fichero mdb |
Tabla |
Campo |
Notas |
| Exportar para bases
de datos en línea |
|
|
|
|
| |
Herbarsys.mdb |
COLECTIO |
Def_InternetDB
(texto 200) [nuevo] |
base de datos para alojar
la copia para Internet |
| |
Herbarsys.mdb |
COLECTIO |
Additional_TB
[texto 50] |
tabla adicional para
copia para Internet |
| |
Herbarsys.mdb |
†††???? ?A?º?
COLECTIO |
Nota_Internet (texto
200) [nuevo] |
Notas |
| Campo de precisión
para la georeferenciación |
|
|
|
|
| |
Tipo "COL.MDB"
u otra externa |
ESPEC |
RadioPunto
[númerico entero largo] |
|
| |
Herbarsys.mdb |
Entrada Rápida |
RadioPunto
[númerico entero largo] |
|
| Campos y tablas
para adscribir las identificaciones a tratamientos
taxonómicos publicados |
|
|
|
|
| |
Tipo "COL.MDB"
u otra externa |
TAXONOMIA [nueva] |
|
Ver estructura en col_plus.mdb
de fichero ZIP |
| |
Tipo "Herbario.MDB" |
Tipo
"Entrada
Rápida" |
TAXONOMIA (Texto 50)
[nuevo] |
|
| |
Tipo "COL.MDB"
u otra externa |
DETER |
TAXONOMIA (Texto 50)
[nuevo] |
|
| |
Herbarsys.mdb |
COLECTIO |
Taxonomia_TB (texto
50) [nuevo] |
tabla para asociar un
tratamiento taxonomico a las identificaciones |
| |
Herbarsys.mdb |
COLECTIO |
Taxonomia_MDB (texto
200) [nuevo] |
el mdb que lo aloja,
path incluido |
Campos recomendados para las tablas DETER, ESPEC, NOMBRES,
ENTRADA RÁPIDA para mejorar la gestión de los datos (si
están presentes se actualizan automáicamente por parte
de Herbar y no se pueden editar por pantalla).
| Nombre |
Tipo |
Contenido |
| Creado |
fecha/hora |
Cuando se crea el registro |
| Modificado |
fecha/hora |
Cuando se modificó por última vez |
| Por_donde |
texto [80] |
Nombre del ordenador y de usuario
desde donde se modificó el registro |
| "Bugs" detectados y solucionados |
Módulos incompletos en Herbar 3.3 o por desarrollar en el futuro |
- Textos en catalán e inglés de las nuevas pantallas.
Esta actualización se hace mediante la actualización
de la tabla BABEL de Herbario.mdb. En cuanto tenga
versiones más completas y actualizadas, las pondré
en las páginas de HERBAR.
- Nueva documentación
- Módulo para georefernciar ejemplares de herbario
a posteriori.
Sigue pendiente:
- Opción para incluir o no el contenido del campo
MUNICIP en las etiquetas de herbario. En el estado
actual es posible incluir este campo "manipulando"
el documento de MS-Word matriz para producir etiquetas
("etinorm1.doc"y similares).
- Pantalla para editar la información de la tabla
tipo "MUNICIP".
- Opción para producir informes de los pliegos --seleccionados
por consultas-- con las imágenes asociadas y sus "links"
externos.
- Nuevas pantallas y opciones para sacar partido de
las posibilidades que brinda una tabla de nombres
(referencias cruzadas, oppciones para búsqueads por
nombres aceptados y sinónimos, correciones semi-automáticas
, etc.
- Textos en catalán e inglés de las nuevas pantallas.
Esta actualización se hace mediante la actualización
de la tabla BABEL de Herbario.mdb. En cuanto tenga
versiones más completas y actualizadas, las pondré
en las páginas de HERBAR.
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