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Nodo Nacional de Información en Biodiversidad

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Taller
Fecha comienzo Taller

27/11/2018

Fecha fin Taller

11/12/2018

Lugar

modalidad online

A cargo de

Alejandro González (RJB-CSIC) y Julia Chacón (Centro de Investigaciones sobre Desertificación - CSIC, Valencia / INIA)

Idioma

Castellano

Máximo nº de participantes

50

Horas estimadas de dedicación

30

Contacto

infogbifspain@gmail.com

Hashtag

#tallerRonline2018

Descripción

Este curso pretende sentar las bases para usar y desarrollar R de una manera autónoma y utilizar el software para manejar, manipular, visualizar y analizar datos de ecología y biodiversidad. Se hace especial énfasis en aquellas herramientas que posibilitan ser un usuario eficiente del programa.

Metodología

El presente curso se desarrollará en la Plataforma de Formación Virtual de GBIF.ES (http://elearning.gbif.es/). Combinaremos la impartición de vídetutoriales donde, en vídeos muy cortos, explicaremos paso a paso, desde las primeras operaciones con el programa como la gestión de archivos, a los rudimentos del análisis estadístico, la programación para trabajar de manera eficiente o los estilos más modernos de trabajo en el entorno R.

Pasos a seguir para matricularse:
  • Rellenar formulario de inscripción hasta el 31 de octubre de 2018.
  • Publicación de lista de alumnos en la página web del taller el 5 de noviembre de 2018.
  • La Unidad de Coordinación de GBIF España contactará con los alumnos admitidos para facilitarles el modo de pago para formalizar la matrícula del taller.
  • Realizar ingreso siguiendo los pasos que se indiquen hasta el 12 de noviembre de 2018*.
  • Enviar a infogbifspain@gmail.com el justificante de pago que será la entrada del curso que generará la lanzadera de pago. Esto se explicará en detalle vía email a las personas admitidas.
*Si no se ha recibido el justificante de pago en dicha fecha, la reserva se anulará automáticamente.

Proceso de selección: Las solicitudes presentadas se someterán a un proceso de selección. Se procurará que en el taller puedan participar el mayor número de instituciones y países interesados, por lo que a la hora de hacer la selección se tendrán en cuenta los siguientes aspectos:

  • Adscripción a una institución que colabore y/o provea datos a través de la red de GBIF.
  • Número de solicitudes presentadas desde esa misma institución.
  • Conocimientos sobre la materia.
  • Solicitud y/o presencia en talleres anteriores de GBIF España.

Requisitos técnicos del taller: Disponer de un ordenador con al menos 4 GB de memoria RAM. Si existen estudiantes del curso que trabajen en entornos Linux o Mac, rogamos contactar con los docentes (jano@rjb.csic.es) para facilitar las instrucciones de cómo instalar los programas R y Rstudio en sus plataformas.

Conocimientos previos: Este curso está concebido para personas sin conocimientos previos de R o con muchas lagunas. Sin embargo puede aportar conocimientos a personas interesadas en aprender programación o escritura eficiente de código.

-- evento realizado, materiales disponibles --

Programa

Módulo 0: PRESENTACIÓN DEL CURSO

  • Presentación del profesorado.
  • GBIF y la información primaria sobre biodiversidad.

Módulo 1: INTRODUCCIÓN

  • Qué es R.
  • Instalación de R.
  • Instalación de R Studio.
  • Partes de R: consola y primeros comandos.
  • Funciones y objetos en R.
  • Partes de R Studio.
  • Optimización de R Studio.
  • Bajada de paquetes.
  • Otras herramientas GUI.

Módulo 2: MANEJO DE DIRECTORIOS

  • Uso de carpetas y ubicaciones.
  • Creación de ficheros y objetos.
  • Empezar con el caso de estudio.

Módulo 3: TIPOS DE OBJETOS

  • Introducción a los tipos de datos y estructuras.
  • Vectores y operaciones con vectores.
  • Matrices.
  • Marcos de datos.
  • Listas y arrays.
  • Operaciones con texto.
  • Otros tipos.

Módulo 4: MANIPULACIÓN DE OBJETOS

  • Operaciones básicas para conocer los objetos.
  • Operaciones de un tipo de dato a otro.
  • Transformación en marcos de datos.
  • Innovaciones en R (tidyverse).
  • Optimización del código mediante el tidyverse.

Módulo 5: GRÁFICOS BÁSICOS

  • Gráficos del paquete básico.
  • Otras operaciones.
  • Ejercicio guiado.

Módulo 6: GGPLOT

  • Filosofía de ggplot.
  • Operaciones básicas de ggplot.
  • Boxplots.
  • Histogramas y densidad.
  • Scatterplots.
  • Barras, etc.
  • Trucos.
  • Leyendas, etiquetas, posiciones.
  • Ejercicio guiado.

Módulo 7: PROGRAMACIÓN EFICIENTE

  • Introducción a la programación y justificación.
  • Bucles for.
  • Bucles while.
  • Condicionales if else.
  • Resolviendo problemas de las simulaciones.
  • Creación de funciones I.
  • Creación de funciones II.
  • Funciones de la familia apply.

Módulo 8: RECURSOS EXTERNOS

  • Ayuda de R.
  • Stack overflow.
  • GitHub.

Módulo 9: PUBLICACIÓN CON R

  • Introducción a R markdown.
  • Generación de trozos de código.
  • Operar con imágenes.
  • Operar con tablas.
  • Operar con índices.
  • Otros tipos.

Módulo 10: INTRODUCCIÓN A LA ESTADÍSTICA

  • Visión general de la estadísitca en R.
  • Primeros pasos de la estadística básica en R.
  • Distribuciones.
  • Obtención de algunos parámetros de los modelos.
  • Estadística no paramétrica.
  • Introducción a modelos más complejos.
  • Ejercicio guiado.

#tallerRonline2018

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Documentos Adjuntos

Listado YouTube de vídeos con las lecciones del taller Archivo comprimido con las presentaciones y materiales utilizados durante el taller

Listado de Participantes

Nº Nombre Organización
1 Instituto Español de Oceanografía (Cádiz)
2 Alonso Felpete José Ignacio Universidad de Oviedo
3 Álvarez Muñiz Clara Universidad Rey Juan Carlos
4 Aparicio Sánchez José Ignacio Doctorando
5 Barberá Sánchez Patricia Missouri Botanical Garden / Real Jardín Botánico - CSIC
6 Belda Aguilar Ignacio Universidad Rey Juan Carlos
7 Bernardo Nicola Estación Biológica de Doñana - CSIC
8 Butrón Mota Ainhize Sociedad Pública de Gestión Ambiental del Gobierno Vasco (IHOBE)
9 Caro Miralles Elvira Universidad Rey Juan Carlos
10 Cezón García Katia GBIF España
11 Checa Herranz Lucía Universidad Rey Juan Carlos
12 Elcano Delgado Irene Universidad Autónoma de Madrid
13 Esquete Garrote Patricia Universidad de Aveiro
14 Gálvez Núñez Ángel Instituto Cavanilles de Biodiversidad y Biología Evolutiva, Universidad de Valencia
15 Gómez Serrano Miguel Ángel VAERSA / Servicio de vida Silvestre. Conselleria de Agricultura, Medio Ambiente, Cambio Climático y Desarrollo Rural
16 González Forero Manuela Estación Biológica de Doñana, CSIC
17 González Rodríguez Luís Universidade de Vigo
18 Lijó Pose Gabriel Empresa privada
19 Lorenzo Rodríguez Paula Centre for Functional Ecology - Science for People & the Planet (Universidade de Coimbra)
20 Lujano Bermúdez Carmen GBIF España
21 Maestre Zuazua Zuriñe Sociedad Pública de Gestión Ambiental del Gobierno Vasco (IHOBE)
22 Marmaneu Palero José María CIBIO - Universidad de Alicante
23 Martínez Pérez Sandra CIBIO - Universidad de Alicante
24 Mesquita Joanes Francesc Universitat de València - ICBiBE
25 Mora Mayoral Berta Universitat de Barcelona
26 Muñoz García Joaquín Estación Biológica de Doñana, CSIC
27 Ortiz Díaz Laura Universidad Rey Juan Carlos
28 Quirce Vázquez Cinta CIBIO - Universidad de Alicante
29 Rincón Rincón Beatriz Universidad de Alcalá de Henares, Grupo de Biodiversidad Marina
30 Rives Pérez Borja Unversidad de Barcelona
31 Robles Vallet Carmen María IFAPA (Instituto de Investigación Agraria y Pesquera)
32 Torre Casado Salustiano Real Jardín Botánico - CSIC
33 Vega Ruiz Miguel Ángel GBIF España
34 Vila Bonfill Albert Parque Natural de les Capçaleres del Ter i del Freser
35 Zas de Uña Emilia Instituto Español de Oceanografía y Empresa Investigación, Planificación y Desarrollo.
36 Zorrozua Gamboa Nere Sociedad de Ciencias Aranzadi