II Taller GBIF.ES: Publicación de datos de biodiversidad en GBIF y en revistas científicas

Descripción

En este taller teórico-práctico tiene como objetivo enseñar a los participantes a elaborar, usar y publicar datos de biodiversidad a través de la red GBIF. Se abordarán aspectos relativos a la calidad, limpieza y depuración de los datos, estandarización y publicación a través de la herramienta Integrated Publishing Toolkit (IPT) así como la preparación de manuscritos para la publicación de data papers.

El taller está dirigido a biólogos, conservadores de colecciones de historia natural y científicos que participan activamente en el monitoreo y gestión de datos de biodiversidad.

Pasos a seguir para matricularse:
  • Rellenar formulario de inscripción hasta el 9 de mayo (AMPLIADO HASTA 17 DE MAYO).
  • Publicación de lista de alumnos en la página web del taller el 17 de mayo de 2018.

Debido al número limitado de plazas disponibles, las solicitudes presentadas se someterán a un proceso de selección donde se evaluarán los siguientes aspectos:

  • Adscripción a una institución que colabore y/o provea datos a través de la red de GBIF.
  • Número de solicitudes presentadas desde esa misma institución.
  • Conocimientos sobre la materia.
  • Solicitud y/o presencia en talleres anteriores de GBIF de la misma temática.
  • Orden de inscripción.

Todos los materiales (vídeos y presentaciones) estarán disponibles una vez concluya el taller.

Programa

Martes, 12 de junio de 2018

MÓDULO 0: Presentación

09:30 – 10:00

MÓDULO 1: CONCEPTOS GENERALES

10:00 –10:30 Introducción a la publicación de datos de biodiversidad - Katia Cezón (GBIF.ES)

  • Sobre la importancia de la publicación de datos de biodiversidad
  • ¿Por qué publicar datos de biodiversidad?
  • Tipos de datos que se pueden publicar, etc.

10:30 - 11:00 Flujo general de publicación de datos de biodiversidad en los portales de GBIF - Katia Cezón (GBIF.ES)

11:00 – 11:30    DESCANSO

MÓDULO 2: CALIDAD Y LIMPIEZA DE DATOS DE BIODIVERSIDAD

11:30 – 12:30 Estructuración de datos a una plantilla Darwin Core  - Paula Zermoglio (Universidad de Buenos Aires), Katia Cezón (GBIF.ES)

12:30 – 13:00  Conceptos básicos de la calidad y limpieza de datos de biodiversidad (definiciones y aspectos teóricos importantes) - Paula Zermoglio (Universidad de Buenos Aires)

13:00 – 13:30 Herramientas útiles para la calidad y limpieza de los datos - Katia Cezón (GBIF.ES)

13:30 – 15:00    DESCANSO - COMIDA

15:00 – 18:00 Open Refine - Paula Zermoglio (Universidad de Buenos Aires)

Miércoles, 13 de junio de 2018

MÓDULO 2: CALIDAD Y LIMPIEZA DE DATOS DE BIODIVERSIDAD (continuación)

09:00 – 10:30  Prácticas con herramientas para la limpieza y control de la calidad de los datos - Katia Cezón (GBIF.ES)

  • Herramientas para la gestión de nombres científicos.
  • Herramientas geográficas.
  • Herramientas para el tratamiento de las fechas.

10:30 – 11:00 Herramientas para la validación de datos: Validador de datos de GBIF  - Katia Cezón (GBIF.ES)

11:00 – 11:30    DESCANSO

MÓDULO 3: PUBLICACIÓN DE DATOS

11:30 – 12:10 Conceptos básicos sobre la publicación de datos de biodiversidad en la red de GBIF: estándar de publicación, metadatos, etc. - Katia Cezón (GBIF.ES)

12:10 - 12:30 Licencias de Uso de los Datos - Miguel Vega (GBIF.ES)

12:30 – 13:30 Introducción al IPT (Integrated Publishing Toolkit) como herramienta de publicación - Katia Cezón (GBIF.ES)

13:30 – 15:00    DESCANSO - COMIDA

15:00 – 16:30 Ejemplo guiado y prácticas de publicación a través del IPT - Katia Cezón (GBIF.ES)

  • Prácticas de publicación simple (registros de biodiversidad, checklist o eventos de muestreo).
  • Prácticas de publicación avanzada (mediante el uso de extensiones de información para complementar la información anterior).

16:30 - 18:00 ¿Cómo se verán los datos una vez publicados? Portales Nacional e Internacional de GBIF - Miguel Vega (GBIF.ES)

Jueves, 14 de junio de 2018

MÓDULO 4: PUBLICACIÓN DE ARTÍCULOS DE DATOS (“DATA PAPERS”) - David Galicia y Nora Escribano (Univ. Navarra)

09:00 – 14:00 Introducción a los data papers: qué son y por qué publicarlos.

  • Del IPT al artículo de datos.
  • Escribir un artículo de datos.
    • ¿Qué secciones se generan automáticamente desde el IPT?
    • ¿Qué secciones hay que incorporar manualmente?
  • Editoriales y editores que publican data papers.
  • Ejemplos de artículos de datos.

Caso práctico: elaboración de un data paper.

Discusión, conclusiones y evaluación del curso.

Alumnos/as del taller
Introducción a GBIF (Miguel Vega)
Introducción a la publicación de datos de biodiversidad (Katia Cezón)
OpenRefine (Paula Zermoglio)
Presencia argentina en el taller
Concentrados/as durante el taller
Data papers (David Galicia)
Alumnas del taller
Práctica sobre data papers (Nora Escribano)
Grupo de participantes en el taller

#publicacionDatos

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Listado de Participantes

  • NombreOrganización
  • 1 Pedro Alfaya Herbello Universidad Complutense de Madrid
  • 2 Antón Álvarez Bermúdez Instituto de Biología de la Conservación
  • 3 Elisa Arroyo Martínez Universidad de Alicante
  • 4 Roberto Cañizares García Universidad Complutense de Madrid
  • 5 Raúl Casado Barbero
  • 6 Francisco Javier Cintero Chamizo Universidad Carlos III de Madrid
  • 7 Nora Escribano Compains Universidad de Navarra
  • 8 Laura Gavioli Instituto Botánico de Barcelona
  • 9 Eydi Yanina Guerrero Medina Universidad Autónoma de Honduras
  • 10 Silvia Jurado Güeto
  • 11 Eduardo López Díaz Instituto Español de Oceanografía (CO Vigo)
  • 12 Carmen Lujano Bermúdez GBIF España
  • 13 Gloria Martínez Sagarra Universidad de Córdoba
  • 14 Ibai Olariaga Ibarguren ARANZADI
  • 15 Pilar Ortega Pérez Universidad de Córdoba (Herbario COCF)
  • 16 Vincent Pardo Universidad de Alicante
  • 17 Antonio José Pérez Delgado Universidad de La Laguna
  • 18 Carlos Prieto Sierra Universidad del País Vasco
  • 19 Carolina Puerta Piñero Instituto de Investigación y Formación Agraria y Pesquera
  • 20 María Josefa Ruiz Aguilera Parque Zoológico Municipal de Córdoba (Ayuntamiento de Córdoba)
  • 21 Asunción Saldaña López Universidad de Alcalá
  • 22 Andrea Seral Puyoles Universidad Complutense de Madrid
  • 23 Miguel Vega GBIF España