II Taller sobre imágenes digitales para estudios de biodiversidad (repetición)
Descripción:
Este taller tratará el proceso de captura, manejo y publicación en internet de imágenes digitales de especímenes de colección y de otras imágenes relacionadas con proyectos de investigación en biodiversidad: láminas, preparaciones microscópicas, etc.
Los temas a tratar irán desde el equipamiento necesario y su configuración (óptica, iluminación, etc.), las técnicas de captura, el procesado de las imágenes y los (meta)datos a recoger para su publicación.
Los alumnos podrán aportar sus propias imágenes, que se procesarán y se publicarán en un servidor instalado al efecto.
Debido al número limitado de plazas disponibles, las solicitudes presentadas se someterán a un proceso de selección donde se evaluarán los siguientes aspectos:
- Adscripción a una institución que colabore y/o provea datos a través de la red de GBIF.
- Número de solicitudes presentadas desde esa misma institución.
- Conocimientos sobre la materia.
- Solicitud y/o presencia en talleres anteriores de GBIF España.
- Orden de inscripción.
Fecha: 14-16 abril 2008
Con la colaboración de CRIA y de la Universidad de Navarra.
Programa
PARTE I: TÉCNICAS AVANZADAS DE IMAGEN DIGITAL. Arturo H. Ariño y David Galicia.
Lunes 14
9:30-11:00 – Sesión introductoria: Teoría de la imagen digital
1. Nociones básicas sobre imagen
- Naturaleza de la luz
- Óptica y formación de la imagen
- Teoría del Color
2. Captura de una imagen
- Química de la película fotográfica tradicional
- Señal analógica y digital
- Sensores digitales
3. Sistemas de imagen digital
- Componentes ópticos y electrónicos
- Equipos de tratamiento de imagen
- Software de análisis
11:00-11:30 – Pausa para café
11:30-13:30 – Sesión teórico-práctica: Adquisición de imagen.
4. Fotografiado de especímenes bidimensionales
- Ejemplares zoológicos bidimensionales
- Plantas de herbario
- Láminas, papel, documentos
5. Fotografiado de especímenes tridimensionales
- Iluminación
- Planos y ángulos de imagen
- Ejemplares de tamaño medio y grande
- Ejemplares para macrofotografía con SLR
- Motorización
6. Fotomicroscopía
- Ejemplares para macrofotografía con estereomicroscopio
- Microfotografía y técnicas de contraste
7. Casos especiales
- Cajas de colección
- Material en líquido
- Imagen morfométrica
13:30-15:00 Pausa para comer
15:00-16:45 – Sesión teórico-práctica: Prevención de problemas en la imagen
8. Problemas fotográficos
- Resolución
- Color
- Geometría
- Artefactos
16:45-17:00 – Pausa para café
17:00-18:00
9. Problemas informáticos
- Pérdida de información
- Conservación, archivo y durabilidad
- Costes
- Compatibilidad de formato
Martes 15
09:30-11:00 – Fotografiado de ejemplares de los alumnos
En esta sesión, por turnos y por grupos de casos, los alumnos fotografiarán sus ejemplares de acuerdo a los criterios estudiados el día anterior. Los alumnos que no estén en el laboratorio tomando las fotos analizarán y criticarán las imágenes del otro grupo, así como las de muestra propuestas por los profesores o las que hayan traído consigo. En la sesión siguiente se abordará el postprocesado, corrección digital y realce.
11:00-11:30 – Pausa para café
11:30-13:30 – Sesión teórico-práctica: Postprocesado y análisis de imagen. Corrección.
10. Procesos generales de la imagen
- Reencuadre y recorte de imagen
- Redimensionamiento
- Ajuste de gama dinámica
- Corrección cromática
- Corrección geométrica
- Limpieza digital
- Ajuste de la nitidez
11. Retoque fotográfico
- Tratamientos parciales en la imagen
- Extracción de fondo
- Filtros
12. Combinaciones de imágenes
- Álgebra de imagen
- Montaje fotográfico
- Stacks y Automontaje
13:30h–15:00 – Pausa para comer
15:00-18:00– Sesión flexible con tiempo para continuar el fotografiado de ejemplares problema y tratamiento de formatos de imagen y metadatos
13. Formatos de imagen
- Formatos digitales sin pérdida
- RAW
- BMP
- TIFF
- Formatos de compresión con pérdida única
- GIF
- CCIT
- Formatos de compresión con pérdida acumulativa
- JPG
14. Metadatos
- EXIF
- Bases de datos de imagen
- Historial de proceso
- Documentación
- IPR
- Trazabilidad
PARTE II: EL PROCESO DE PUBLICACIÓN DE IMÁGENES DIGITALES EN INTERNET. Silvia Lusa
Miércoles 16
9.30 – 11:00
Proyectos y bibliotecas digitales en Internet
- El ejemplo de Flora brasiliensis
- La obra y El proyecto
- Proceso de digitalización, organización del banco de imágenes y metadatos
- Sitio web. Flora brasiliensis y Flora brasiliensis revisada. Integración con búsquedas externas.
- Otros proyectos (Biblioteca digital del Real Jardín Botánico, Herbario de Berlín, Morphobank, etc.)
Repositorio de archivos vs Servidor de imágenes (e-Rez, iseemedia).
Visualizadores (zoomyfer, FSI Viewer).
11:00- 11:30 Pausa para café
11:30-13:30 Parte práctica: publicación en Internet de imágenes aportadas por los alumnos.
- Caso práctico I
Integración de imágenes digitalizadas por los alumnos en un servidor de imágenes
- Caso práctico II
Integración de imágenes digitalizadas por los alumnos con el visualizador zoomyfer
Documentos Adjuntos
Formulario de preinscripción (enviar antes del 28 de marzo del 2008) Publicación de imágenes digitales de biodiversidad en internet. Silvia Lusa (1.40 Mb; Archivo .PPT)
Listado de Participantes
- Nº Nombre Organización
- 1 Ana Macías Palomo Universidad Politécnica Madrid
- 2 Rita Borges Universidade do Algarve
- 3 Patricia Lattig Universidad Autónoma Madrid
- 4 Antonio Martín Ciudad CSIC-Real Jardín Botánico
- 5 Inmaculada Férriz Murillo Associacio TAIB
- 6 Rocío Astrid Bernal Garzón Universidade do Porto
- 7 Raquel López Luque Estación Biológica Doñana
- 8 Bárbara Aru Universidad de León
- 9 Diego Fernando Higuera Díaz www.sentidonatural.org
- 10 Manuel Yuste Salguero Universidad de Almería
- 11 María Eva Hernández Plaza Museo Nacional de Ciencias Naturales (CSIC)
- 12 Ester Lusa Bernal Real Jardín Botánico Madrid (CSIC)
- 13 Laura Hernández Javier Museo Nacional de Ciencias Naturales (CSIC)
- 14 Laura San Segundo González Museo Nacional de Ciencias Naturales (CSIC)
- 15 Teresa García Díez Museo Nacional de Ciencias Naturales (CSIC)
- 16 Beatriz López González Universidad de Salamanca
- 17 José García Sánchez Universidad de Málaga, Dpto. Biología Vegetal, Fac. Ciencias. [Herbario]
- 18 Katia Cezón García CSIC-Real Jardín Botánico
- 19 Natalia Conejero Ortega Instituto Cavanilles de Biodiversidad y Biología Evolutiva (Valencia)
- 20 Pedro Miguel Ramos Arsénio Universidade Técnica de Lisboa
- 21 Nicolás Pérez Hidalgo Universidad de León
- 22 Lara Navarro Cerveró Universidad de Valencia
- 23 Isabel Rey Fraile Museo Nacional de Ciencias Naturales (CISC)