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Introducción al programa VegAna para la gestión y análisis de datos florísticos y ecológicos

Descripción:

Curso introductorio a VegAna (Vegetation edition and Analysis). Se trata de un paquete integrado de programas destinado a la gestión y análisis de datos ecológicos en general y muy especialmente de vegetación. Contiene 4 programas principales entrelazados:

  • Ginkgo: orientado a la representación y clasificación de individuos a partir de datos multivariantes.
  • Quercus: es un editor de tablas de datos de tipo inventario. Permite la introducción y gestión de inventarios de especies.
  • Fagus: Es un editor y gestor de citas florísticas. Se pueden almacenar datos inéditos, bibliográficos y de colecciones.
  • Yucca: Permite la representación cartográfica de los datos, principalmente distribuciones de taxones y grupos de áreas.

Podrá encontrar más información en: http://biodiver.bio.ub.es/vegana, donde se encuentran también las instrucciones de uso de cada programa.

Debido al número limitado de plazas disponibles, las solicitudes presentadas se someterán a un proceso de selección donde se evaluarán los siguientes aspectos:

  • Adscripción a una institución que colabore y/o provea datos a través de la red de GBIF.
  • Número de solicitudes presentadas desde esa misma institución.
  • Conocimientos sobre la materia.
  • Solicitud y/o presencia en talleres anteriores de GBIF de la misma temática.
  • Orden de inscripción.

Programa

Lunes  21 de diciembre de 2009

9:30 - 11:00

Bienvenida e introducción al curso

GBIF e información primaria sobre biodiversidad

Generalidades: Visión general del proyecto VegAna. Instalación de los módulos y prerrequisitos del sistema. Ficheros de un proyecto de trabajo, configuración, descarga y actualización de tesauros (taxonómicos y sintaxonómicos).

11:00 - 11:30  Pausa café

11:30 - 13:30

Módulo Fagus: Introducción de citas florísticas (observaciones de campo, pliegos de herbario y citas bibliográficas), importación de datos TXT y XML (Anthos, BDBC, BioCase y GBIF).

13:30 - 15:00. Pausa comida.

15:00 - 17:00

Módulo Zamia: Instalación del programa en una PDA conexión con un GPS. Demostración de la toma de datos (observaciones e inventarios) en el campo (Jardín Botánico).

Módulo Yucca: Importación de mapas y calibrado de imágenes cartográficas. Uso de capas WMS. Elaboración de mapas de distribución.

17:00 - 17:20 Pausa para café

17:20 - 19:00.

Módulo Fagus: Edición de tesauros. Impresión de etiquetas, elaboración de floras y documentos. Elaboración y análisis de datos. Cartografía de especies.

Martes 22 de diciembre de 2009

9:00 - 11:00

Módulo Quercus: Informatización de inventarios de vegetación. Importación de inventarios en formato xml (BDBC y SIVIM). Edición de tablas de inventarios y tablas sintéticas. Análisis manual y automatizado de tablas. Espectros biológicos. Cartografía de comunidades. Exportación de citas florísticas a Fagus.

11:00 - 11:30  Pausa café

11:30 - 13:30

Módulo Quercus: Análisis manual y automatizado de tablas. Espectros biológicos. Cartografía de comunidades. Exportación de citas florísticas a Fagus.

13:30 - 15:00. Pausa comida.

15:00 - 17.00

Módulo Ginkgo: Importación/exportación de datos. Cálculo de índices de similaridad/disimilaridad.Introducción al análisis multivariante de datos. Métodos de ordenación (PCA, PcoA y CA) y métodos de clasificación jerárquicos y no jerárquicos (K-means y Fuzzy C-means. Estudio de la fidelidad de las especies a las comunidades.

17:00 - 17:30

Evaluación, aclaración de dudas y cierre del curso.

Documentos Adjuntos

Vídeos del taller

Documentos de Interés

Proyecto Fagus empaquetado Presentación http://biodiver.bio.ub.es/FontMaster2008/UTM-Catalunya.txt Var. ambientales Cataluña Fidelidad Modelo de tesauro a importar a Vegana K-means Formato importación de tablas

Enlaces de Interés

http://biodiver.bio.ub.es/vegana/castellano/index.html

Listado de Participantes

  • Nº Nombre Organización
  • 1 Carlos Lado Rodríguez MYXOTROPIC. Myxobiota Neotropical. Estudio biosistemático de Myxomycetes de las zonas áridas
  • 2 David García San León Universidad de Santiago de Compostela, Laboratorio de Botánica, Fac. Farmacia. [Herbario]
  • 3 Juan Gabriel Fernández Fernández
  • 4 Mª Rosa Fernández Calzado
  • 5 Ricardo Ibáñez Gastón Universidad de Navarra. Departamento de Biología Ambiental
  • 6 Julia Chacón Labella
  • 7 José Miguel Castillejo Moreno
  • 8 María Luisa Rubio Teso
  • 9 María Pilar Rodríguez Rojo
  • 10 José Antonio González Oreja
  • 11 David Galicia Herbada
  • 12 Daniel de la Torre Llorente
  • 13 Maria Paz Errea Abad
  • 14 Alberto Rodríguez García
  • 15 Gonzalo Hernández Palacios
  • 16 Amador Prieto
  • 17 Introducción al programa VegAna para la gestión y análisis de datos florísticos y ecológicos
  • 18 Virginia Garófano Gómez
  • 19 Clara Laguna Defior
  • 20 Beatriz López González