Taller sobre provisión de datos colombianos al GBIF en el marco del SIB Colombia

Descripción:

El propósito de este taller es divulgar entre los participantes los principales avances en el área de la gestión de información biológica en los ámbitos nacional e internacional; involucrarlos en la activa provisión de datos y metadatos a la red nacional SiB Colombia y a GBIF, e incrementar en ellos y en sus instituciones la capacidad para el uso de las herramientas técnicas, tecnológicas y procedimientales generadas por el SiB y sus socios internacionales, que les permitan ampliar el potencial de uso de sus datos y compartir su información al país y al mundo apropiadamente.

Este taller está enmarcado dentro del Proyecto conjunto de colaboración con los Nodos de Holanda, Colombia y España.

Fecha: 27-29 Mayo 2008

Programa

DÍA 1- 27 de mayo Publicación de datos en la red de GBIF (o en línea)

08:30   Presentación del Taller. Objetivos, agenda de trabajo y resultados esperados, equipo de docentes.
Ximena Franco Villegas, Investigadora Principal SiB.

08:50   Presentación. Introducción a GBIF. (Archivo .ppt; 3.63 Mb).
Francisco Pando, Responsable Unidad de Coordinación GBIF.Es

09:00   Presentación. Estándares y protocolos para especímenes en el ámbito de SiB Colombia y GBIF.
Repaso de conceptos clave (Archivo .ppt; 1Mb)
Angela M. Suárez Mayorga, Administradora líder de contenidos SiB.

10:00   Taller: De la base de datos de trabajo, a la de publicación: mapeo de campos y otras transformaciones
Francisco Pando, Responsable Unidad de Coordinación GBIF.Es

Name parser (https://www.gbif.es/datos-biodiversidad/participa-en-gbif-es/herramientas-de-publicacion/)

Se trata de una aplicación con base de datos MS Access 2000® para desglosar nombres científicos en sus componentes básicos: género, especie, autor y año: name_parser.zip (archivo .ZIP, 51 Kb). Autor: F. Pando. Se ha adaptado esta misma aplicación para aquellos nombres que vengan compuestos de género, especie, Autor_especie, Rango infraespecífico, Infraespecífico, Autor_infraespecífico y año: name_parser_New.zip (archivo .ZIP, 83 Kb). Adaptación: I. Ortega.

Name Parser (Archivo .mdb; 416 Kb).
Ejemplos Name Parser (Archivo .mdb; 36 Mb)

UuBio's PaseIt (http://www.ubio.org/tools/explodeMan.php)
Esta función acepta la entrada de la combinación de un nombre científico, autor y año y la separa en sus componentes como texto plano.

Publicación de datos en la red de GBIF o en linea. Francisco Pando (Archivo .ppt; 807 Kb).

10:45  Refrigerio

11:00  Continuación Taller.

Validación
Darwin test
(www.gbif.es)
Una aplicación para la validación y chequeo de los datos en formato Darwincorev2, para asegurar una calidad en las bases de datos que se ven a través de la red de GBIF

Esquema original de Darwin Core 2 - Inglés (Archivo .pdf; 529 Kb). Esquema no oficial de Darwin Core 2 - Español (Archivo .pdf; 522 Kb).
Tabla de Darwin Core v.1.4 (Archivo .mdb; 3.49 Mb).
Mapeo Darwin Core v. 14 (Archivo .mdb; 3,6 Mb) . Para transformar tablas de la versión actual de Darwin Core (1.2) a la versión que se va a empezar a implementar (1.4)
Mapeo de campos (Archivo .doc; 361 Kb).

11:45  Presentación. Georreferenciación de ocurrencias. Introducción a mejores prácticas. (Archivo .ppt; 7.2 Mb)
Oscar Orrego, Administrador de contenidos-Productos y Servicios SiB.

Basado en talleres de GBIF, como por ejemplo: https://www.gbif.es/talleres/replica-del-ii-taller-sobre-georreferenciacion-de-gbif/
GBIF's Guide to Best Practices for Georeferencing

12:45  Almuerzo

14:15   Taller: Provisión de datos a GBIF. (Archivo .ppt; 831 Kb).
Silvia Lusa Responsable de la Infraestructura ITC  de GBIF España.

15:45   Refrigerio.

16:00   Taller: Metadatos
Mónica Vera A. Administradora del Catálogo nacional de metadatos de conjuntos de datos relacionados con biodiversidad.
Francisco Pando, Responsable Unidad de Coordinación GBIF.es

DÍA 2- 28 de mayo Administración de información de especies.

08:30   Presentación. Plinian Core - Introducción, historia, requerimientos, objetivos.
Francisco Pando.

Plinian Core. Un perfil de datos para publicar y compartir información de especies biológicas. Francisco Pando (Archivo .ppt; 1.3 Mb).
Plinian Core. Conceptos (Archivo .pdf; 103 Kb).

09:15   Presentación. Plinian Core: su forma actual.
Francisco Pando.

Plinian Core. Atributos Flora Ibérica (Archivo .pdf; 93 Kb)
Poster Plinian Core v2 (Archivo .pdf; 780 Kb).

09:45    Presentación. De desarrollo teórico a la realidad.
Francisco Pando.

1. El portal de IABIN Video portal de especies (IABIN). Francisco Pando.

2. El portal de gbif.es Video portal de gbif.es. Francisco Pando (Archivo .swf; 1.9 Mb).

10:30    Valoración
            Francisco Pando

11:00    Refrigerio

11:15    Conversatorio/ Sesión de discusión.
            Ángela M. Suárez Mayorga, Francisco Pando. Todos los participantes

12:30    Almuerzo.

14:00    Presentación. Hacia una(s) herramienta(s) de captura.
Francisco Pando

Herramientas de captura (Archivo .zip; 989 Kb)

Notación etiquetas Wiki para especies.

14:30    Presentación. El catálogo de especies colombianas SiB. Oscar Orrego. (Archivo .ppt; 2 Mb)

15:30    Refrigerio

15:45    Taller. Documentación de fichas de especies. Oscar Orrego, Mónica Vera. (Archivo .ppt; 700Kb).

17:15   Sesión de cierre.

DÍA 3- 29 de mayo

08:30    Presentación. Esquema SiB de gestión de información sobre biodiversidad. Ximena Franco Villegas. (Archivo .ppt; 7.4 Mb)

09:15    Presentación. Introducción a los productos y servicios de información.  Oscar Orrego. (Archivo .ppt; 305 Kb)

09:30    Presentación. Sistema distribuido de búsquedasÁngela M. Suárez Mayoraga. (Archivo .ppt; 1.7 Mb)

10:00    Presentación. El papel de los metadatos en la gestión de información de especímenes. Ángela M. Suárez Mayoraga. (Archivo .ppt; 2.3 Mb).

10:30    Refrigerio.

10:45    Presentación. Ruta gestión de información de especímenes. Paola Andrea Cubillos. Administradora de contenidos SiB. (Archivo .ppt; 2.5 Mb).

11:15    Presentación. Metadatos en el SiB Colombia. Ángela M. Suárez Mayoraga. (Archivo .ppt; 5.4 Mb).

12:00    Almuerzo.

14:00    Presentación. Servicios de búsqueda y divulgación de información. María Andrea Oriuela. Administradora de contenidos SiB. (Archivo .ppt; 432 Kb).

14:30    Presentación. Indicadores de conocimiento sobre biodiversidad.  Oscar Orrego. (Archivo .ppt; 23 Mb).

15:00    Presentación. Sesión de trabajo para aclaración de dudas y aplicación de herramientas a datos propios. Todos los participantes.

16:00    Refrigerio.

16:15    Continuación Taller.

16:45    Sesión de cierre.

Documentos Adjuntos

Listado completo de participantes Introducción a GBIF. Francisco Pando (Archivo .ppt; 3.63 Mb) Repaso de conceptos clave. Ángela M. Suárez Mayorga (archivo .ppt; 1Mb) Mapeo de campos (Archivo .doc; 361 Kb) Name Parser (Archivo .mdb; 416 Kb) Ejemplos Name Parser (Archivo .mdb; 36 Mb). Esquema original de Darwin Core 2 - Inglés (Archivo .pdf; 529 Kb) Esquema no oficial de Darwin Core 2 - Español (Archivo .pdf; 522 Kb). Tabla de Darwin Core v.1.4 (Archivo .mdb; 3.49 Mb) Mapeo Darwin Core v. 14 (Archivo .mdb; 3,6 Mb) Provisión de datos a GBIF. Silvia Lusa (Archivo .ppt; 831 Kb) Publicación de datos en la red de GBIF o en linea. Francisco Pando (Archivo .ppt; 807 Kb) Plinian Core. Un perfil de datos para publicar y compartir información de especies biológicas. Francisco Pando (Archivo .ppt; 1.3 Mb) Plinian Core. Conceptos (Archivo .pdf; 103 Kb) Plinian Core. Atributos Flora Ibérica (Archivo .pdf; 93 Kb) Poster Plinian Core v2 (Archivo .pdf; 780 Kb) Portal de especies (IABIN). Francisco Pando (Archivo. swf; 1.16 Mb) Portal de gbif.es. Francisco Pando (Archivo .swf; 1.9 Mb) Herramientas de captura (Archivo .zip; 989 Kb) El catálogo de especies colombianas SiB. Oscar Orrego. (Archivo .ppt; 2 Mb) Documentación de fichas de especies. Oscar Orrego, Mónica Vera. (Archivo .ppt; 700Kb). Esquema SiB de gestión de información sobre biodiversidad. Ximena Franco Villegas. (Archivo .ppt; 7.4 Mb) Introducción a los productos y servicios de información. Oscar Orrego. (Archivo .ppt; 305 Kb) Sistema distribuido de búsquedas. Ángela M. Suárez Mayoraga. (Archivo .ppt; 1.7 Mb) El papel de los metadatos en la gestión de información de especímenes. Ángela M. Suárez Mayoraga. (Archivo .ppt; 2.3 Mb) Ruta gestión de información de especímenes. Paola Andrea Cubillos. (Archivo .ppt; 2.5 Mb) Metadatos en el SiB Colombia. Ángela M. Suárez Mayoraga. (Archivo .ppt; 5.4 Mb) Servicios de búsqueda y divulgación de información. María Andrea Oriuela. (Archivo .ppt; 432 Kb) Indicadores de conocimiento sobre biodiversidad. Oscar Orrego. (Archivo .ppt; 23 Mb)